如何爲python，R和bash腳本編寫makefile

我是一名統計人員，我最近爲一個研究項目編寫了一個bash管道，它基本上是一個主要的bash腳本，在每一步調用bash，python和R腳本分析，當然還有很多步驟和很多腳本。我的朋友告訴我，我可以爲他們創建一個makefile，但除了編寫腳本之外，我幾乎沒有計算機上的經驗。我找到了一些例子，但他們是爲VC。我的病例是否也需要像VC程序一樣編譯？任何人都可以與我分享他的一些經驗嗎？例如，我有main.sh，它調用step1.py，step2.sh，step3.r和step2.sh調用step2.1.py，step2.2.r如何通過makefile鏈接它們？如何爲python，R和bash腳本編寫makefile

來源

2012-03-16 user1269298

不，你不需要編譯Python，R或Bash腳本。你認爲你需要一個Makefile嗎？ – 2012-03-16 18:14:26

Make非常適合製作文件（儘管它可以做其他事情）。當一個進程的輸出文件是另一個進程的輸入文件時，它尤其擅長在DAG中創建文件;如果有人修改了一些輸入文件，Make會確定哪些步驟需要將所有內容更新*，然後執行。如果這聽起來像你的情況，我們很樂意幫助你;否則，Make不適合你的工作，並且沒有理由採用它。 – Beta 2012-03-16 18:24:37

作爲一種語言提供一些非常強大的宏/文本替換機制。即使你的代碼沒有處理文件上的任何數據，我也發現在Bash之上使用Make作爲圖層/協調器非常強大。如果看起來每個腳本之間都存在一個複雜的依賴關係網絡，並且您希望將這些依賴關係表示爲位於所有這些腳本之上的文件，那麼IMO Make實際上可能對您很有幫助。 – 2012-03-17 03:38:22

step1: 
    step1.py;\ 
    $(MAKE) step2;\ 
    step3.r 

step2: 
    step2.1.py;\ 
    step2.2.r 

all: step1 
    echo "Done"

從您的描述中，它聽起來像main.sh和step2.sh，只是調用python和R腳本。如果是這樣的話，那麼上面的Makefile就會替換它們。如果他們有其他步驟，那麼您可以在step1或step2目標中添加這些bash命令。

像這樣使用Makefile將允許您僅執行部分執行序列以進行調試。

來源

2012-03-29 12:57:43

很好，謝謝Brant – user1269298 2012-04-09 22:19:45

@ user1269298如果這對你有用，請接受答案。 – 2012-04-10 00:15:50

如何爲python，R和bash腳本編寫makefile

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