分區循環到使用OpenMP

請原諒我，如果這個問題已經回答過了獨特的任務，我想不通這是正確的關鍵字。分區循環到使用OpenMP

我想並聯了很多電話來使用OpenMP Linux命令的運行。我需要保證在一些情況下，每個工作人員等待命令完成並且命令可以花費不同的時間完成。爲了簡化這個問題，我試圖生成命令將運行的文件的名稱，但是每個文件名已經被多次生成，但是文件的名稱是唯一的。我如何修改以下代碼行以通過文件名實現唯一調用（因此對命令的唯一調用）使用OpenMP？

omp_set_num_threads(8); 
    #pragma omp parallel for private(command, dirname) shared(i_traj) schedule(dynamic) 
     for(i_traj=0; i_traj<G.size(); i_traj++) 
     { 
    //command will contain the comand line. 
      snprintf(dirname1,sizeof(dirname1), "ID%i_Trajectory_%i",ID,G[i_traj].ID); 
      dirname = string(dirname1); 
      /*Initializing the trajectories*/ 

      cout<<"Going to: "<<G[i_traj].folder_addr<<endl; 
     }

這部分代碼將在功能中執行，而不是在主程序中執行。使用MPICH2可以做同樣的事情嗎？

更新： 問題與我的電腦有關，而與代碼無關，因爲代碼可以正常使用另一臺機器。任何建議？

升級：

試圖按照吉爾的建議步驟，我升級了代碼如下：

#include <iostream> 
#include <string> 
using namespace std; 
#define LARGE_NUMBER 100 
double item[LARGE_NUMBER]; 
void process(int ID, nucleus &tr) 
{ 
    char dirname1[40]; 
    string command; 
    string script_folder; 
    snprintf(dirname1,sizeof(dirname1), "ID%i_Trajectory_%i",ID,tr.ID); 
    string dirname; 
    dirname = string(dirname1); 
    /*Initializing the trajectories*/ 
    cout<<"Running: "<<dirname<<endl; 
    script_folder = "./"+ dirname; 
    chdir(script_folder.c_str()); 
    //command = "qsub " + dirname+"_PBS" + ".sh";                                     
    command = "gamess-2013 " + dirname + ".inp 01 1 "; 

    printf ("Checking if processor is available..."); 
    if (system(NULL)) puts ("Ok"); 
    else exit (EXIT_FAILURE); 
    if(!tr.runned) 
    { 
     int fail= system(command.c_str()); 
     tr.runned=true; 
    } 

    chdir("../"); 
    return; 
} 

int main() { 

    #pragma omp parallel 
    { 
    #pragma omp single 
    { 
     int i; 
     for (i=0; i<LARGE_NUMBER; i++) 
#pragma omp task 
     // i is firstprivate, item is shared                                      
     process(i); 
    } 

    } 
return 0; 
}

但是每個文件只處理一次保障的問題仍然存在。我怎樣才能確保每個任務在獨特的文件上工作，等待命令執行完成？

來源

2015-11-06 user3116936

很抱歉，但我真的不明白無論你問的問題，也不是它的背景。這句話特別困惑我很多：

爲了簡化這個問題，我試圖生成命令將運行的文件的名稱，但每個文件名已被多次生成，但名稱該文件是唯一的。

反正，所有的說，我的答案很可能只是錯過了這一點。不過，我仍然可以報告你的代碼段中的一個重大問題：你明確聲明shared索引您嘗試parallelise循環i_traj。這是沒有意義的，因爲如果你想在OpenMP並行循環private一個變量，這是循環索引。此外，OpenMP標準明確禁止它section 2.14.1.1。（重點是礦）

的循環迭代變量（多個）在相關聯的for循環的一個（或多個）用於或平行於構建體（是）私人。

具有預定數據共享屬性的變量在數據共享屬性子句中可能未列出，下面列出的情況除外。 僅對於這些例外，列出數據共享屬性子句中的預定變量被允許並覆蓋變量的預定數據共享屬性。

遵循異常的列表，其中使shared未提到的「循環迭代變量（多個）」。

所以，我的答案可能完全錯過了這一點，但你肯定有一個問題，你最好先解決，然後再嘗試深入。

來源

2015-11-06 06:18:08 Gilles

感謝您的回答，試圖考慮您的觀察結果，我編輯了添加代碼的問題，以獲得更安全的方法。 – user3116936

分區循環到使用OpenMP

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