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好吧,這可能代表我對錶格對數據框的無知。我有一個稱爲tbb的表,它由來自名爲mydata的數據框的東西組成。 然後我使用colsums做了一些彙總統計,我想他們會將colsums轉換回數據框。但是當我這樣做似乎只承認兩列一列的一個:如何將一維錶轉換爲具有兩列的數據框
這是我colsums
LSU-rRNA_Hsa LTR1 LTR10A LTR10B LTR10B1
309 90 351 404 183
LTR10C LTR10D LTR10E LTR10F LTR10G
181 675 173 72 231
LTR12 LTR12 LTR12B LTR12C
333 359 15 144
But when I then convert this to a dataframe I get
LSU-rRNA_Hsa 181
LTR1 675
LTR10A 173
LTR10B 72
LTR10B1 231
LTR10C 309
LTR10D 90
LTR10E 351
LTR10F 404
LTR10G 183
LTR12 379
LTR12_ 273
LTR12B 86
LTR12C 497
大的結果。直到我做ncol,它告訴我,我只有一列是數字,而不是LTR等等。爲什麼這和我在轉換中做錯了什麼?代碼如下:
mydata = read.table("/Users/Repeats.txt")
#General tidy up
mydata[4:6] <- NULL
mydata[5] <- NULL
names(mydata) <- c("chrom", "chromStart", "chromEnd","Rptname")
tbb <- table(mydata$chromStart,mydata$Rptname)
tbb[tbb == 0] <- NA
tbb[tbb > 0] <- 1
coll <- as.data.frame(colSums(tbb,na.rm = TRUE))
這些可能只是您的行名。您可以隨意提取並保存它們。嘗試'row.names(coll)'。 – 2015-02-07 20:33:18
啊,他們是行名。所以最終的目標是根據行名稱繪製數字。數據框調用一列colSums(tbb,na.rm = TRUE)。所以當我嘗試創建名稱爲((colSums(tbb,na.rm = TRUE)))< - c(「mycol」)+ plot(mycol)的情節時,沒有x軸 – 2015-02-07 20:40:43