從另一個包導入S3方法

我試圖從另一個包pls導入S3方法predict。我有一個使用這些預測值的函數。問題是，編譯包的時候：從另一個包導入S3方法

Error : object 'predict' is not exported by 'namespace:pls'

我已經把this Gist作爲一個小例子，其中突出了我的問題，包含以下R檔：

#' Test function 
#' 
#' @importFrom pls predict 
#' 
#' @export 

myfunc <- function(x){ 
    stopifnot(class(x) == "mvr") 
    predict(x)*2 
}

來源

2013-03-22 sebastian-c

這裏的主要問題是請注意未定義函數/方法predict。它爲通用的predict提供了幾種方法，但不是泛型本身。

您需要從統計導入通用包，如果你需要它 - 我不知道你這樣做，你沒有創建一個需要或建立在通用的功能。在最低限度，你需要

#' @importFrom stats predict

雖然你可能需要/想導入整個統計命名空間 - 取決於你的包的確超出你目前正在使用的功能是什麼。

的另一個問題是，predict.mvr是不從PLS出口命名空間

> require(pls) 
Loading required package: pls 

Attaching package: ‘pls’ 

The following object(s) are masked from ‘package:stats’: 

    loadings 

> predict.mvr 
Error: object 'predict.mvr' not found 
> pls::predict.mvr 
Error: 'predict.mvr' is not an exported object from 'namespace:pls' 
> pls:::predict.mvr 
function (object, newdata, ncomp = 1:object$ncomp, comps, type = c("response", 
    "scores"), na.action = na.pass, ...)

因此，你不能僅僅將其導入。因此，您的包需要在DESCRIPTION中有Depends: pls才能找到正確的predict方法。

來源

2013-03-22 06:05:54

或者，不要在描述代碼中放入'pls'，直接使用'pls ::: predict.mvr'（並確保'pls'至少在描述IMPORTS中以保證其安裝）。 – Gregor 2016-05-26 18:14:32

直接使用'pls ::: predict.mvr'並不好，三重冒號表明您在作者不想要的地方徘徊。 – 2016-09-02 15:55:17

從另一個包導入S3方法

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