如果無法安裝R軟件包，我該如何使install.packages返回錯誤？

install.packages()如果無法安裝包（例如，如果不可用），將返回警告;例如：如果無法安裝R軟件包，我該如何使install.packages返回錯誤？

install.packages("notapackage")

（編輯：我想拋出一個錯誤，不管包不能安裝，而不僅僅是一個丟失的包裹的這個例子情況的原因）。

我在腳本運行install.packages命令，我想它引發相應的錯誤與退出執行。我在install.packages內部看不到一個明顯的選項來處理這種行爲。有什麼建議麼？

來源

2014-10-07 cboettig

首先檢查'available.packages（）'？函數（...）{ifelse（任何（grepl（「警告」，capture.output（install.packages（...）））），1，0 - 文本匹配'install.package2 < – 2014-10-07 20:22:58

可怕可怕可怕溶液）}''和'cake.installer（「cake」）; cake.installer（「lmtest」）' – Vlo 2014-10-07 20:28:36

@Vlo是的，我的想法也是。也許我們可以用'withCallingHandlers（）'做得更好...... – cboettig 2014-10-07 20:37:47

擴大在快速評論：

R> AP <- available.packages() 
R> "notapackage" %in% AP[,1]  # expected to yield FALSE 
[1] FALSE 
R> "digest" %in% AP[,1]   # whereas this should be TRUE 
[1] TRUE 
R>

來源

2014-10-07 20:26:21

我選了一個不好的小例子。我們希望解決方案在install.packages（）失敗時引發錯誤，無論原因如何（無法編譯等），而不僅僅是缺少包的情況。 – cboettig 2014-10-07 20:28:55

請參閱'help（install.packages）'並檢查返回值。依我看，他們答應你一個無條件'NULL'所以我擔心_No mas_除非你搶佔（我認爲）或重寫... – 2014-10-07 20:31:04

正確，'install.packages'返回NULL不管。我不遵循我如何搶佔軟件包安裝失敗的各種原因... – cboettig 2014-10-07 20:34:20

R函數WithCallingHandlers()讓我們去處理有明確定義函數的任何警告。例如，如果R收到任何警告（並將警告消息作爲錯誤消息返回），則可以告訴R停止。

withCallingHandlers(install.packages("notapackage"), 
        warning = function(w) stop(w))

我猜測，這是不理想的，因爲大概一個包可以成功安裝，但仍然拋出一個警告;但沒有遇到過這種情況。正如Dirk所說，測試require的軟件包可能更穩健。

來源

2014-10-07 20:50:13 cboettig

這可能會做到。在缺少的包中，我們得到了'stop（）'，接下來的問題是一個失敗的構建（缺少頭文件......）是否會被捕獲。 – 2014-10-07 20:57:06

是的，丟失標題等都會引發一般性警告：例如'警告消息：在install.packages（「XML」）：安裝包 'XML' 的發生有非零退出status'上'install.packages（「XML」）''上的debian-R-base'其缺少'libxml2' – cboettig 2014-10-07 21:02:58

如果無法安裝R軟件包，我該如何使install.packages返回錯誤？

回答

相關問題