從數據框中排序和創建文本文件

我是R新手，並試圖讓我的生活更輕鬆。我有一個數據框，其中有幾列，大小會有所不同。主要是一個「基因」列，其餘的將是不同患者/病情的表達數字數據。我想1）按每個數字列排序，2）創建僅包含'基因'列和每個數字列的文件。我試圖爲此生成一個for循環。使用內置的數據庫mtcars爲例，我生成了以下代碼：從數據框中排序和創建文本文件

mtcars 

for (i in 2:ncol(mtcars)) { 
    twocolumns <- data.frame(mtcars[,c(1,i)]) 
    write.csv(twocolumns, paste0(i,'.txt'), row.names = F) 
}

這將創建名稱爲1,2,3,4 ...'.txt'的文件。我如何製作這些名稱，使其與列具有相同的名稱？

另外我還沒有想出排序的一部分。到目前爲止，我已經試過這

mtcars <- mtcars[order(i),]

（以下簡稱「twocolumns」前行的權利，但這種創造1列，2頁的文件。）

任何幫助將不勝感激！

來源

2016-10-24 Alvaro Alvarado

對於名稱問題，請將我替換爲colnames（twocolumns [2]）由於您不關心rownames，因此我使用dplyr :: arrange按每個數據框的col1和col2進行排序。

mtcars 
require(dplyr) 
for (i in 2:ncol(mtcars)) { 
    twocolumns <- data.frame(mtcars[,c(1,i)]) 
    twocolumns<-arrange(twocolumns,twocolumns[,1],twocolumns[,2]) 
    write.csv(twocolumns, paste0(colnames(twocolumns[2]),'.txt'), row.names = F) 
}

來源

2016-10-24 00:40:40 akaDrHouse

非常感謝。其實我只想按column2排序，所以我忽略了[，1]，只保留了[，2]。另一個答案也適用，並且是不使用dplyr的替代方案。 –

如果你在任何時間使用R，dplyr和其他圖書館成員（tidyverse）是你永遠不知道你需要的深深迷失的朋友。 – akaDrHouse

解決方案在基礎R：

for (i in 2:ncol(mtcars)) { 
    twocolumns <- data.frame(mtcars[,c(1,i)]) 
    write.csv(twocolumns[order(twocolumns[, 2]), ], paste0(colnames(mtcars)[i],'.txt'), row.names = F) 
}

說明：您要訂購您的dataframe基礎上，值的第二列，因此twocoloumns[order(twocolumns[, 2]), ]。 colnames(...)返回dataframe的列名稱向量。用colnames(...)[i]提取 t t條目。

來源

2016-10-24 01:06:00

很棒的建議。我沒有想到在創建雙列之後整合排序（順序）。謝謝您的幫助！另一個答案也適用，但它使用dplyr。 –

從數據框中排序和創建文本文件

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