ggplot和plot如何處理inf值的不同？

我在努力理解爲什麼ggplot和plot產生的數據略有不同。 ggplot包含的inf值最高，而plot則不是。ggplot和plot如何處理inf值的不同？

with(geneFDR, plot(log2(FC), -log10(FDR), pch=20, main="FDR vs. Real FC", 
col=geneFDR$FDRColor))

ggplot(data=geneFDR, aes(x=log2(FC), y=-log10(FDR), color=FDRFCthreshold)) + 
    geom_point(alpha=0.4, size=1.75) + 
    ggtitle("FDR vs. Real Fold Change") + 
    xlab("log2 Real Fold Change") + ylab("-log10(FDR)")

INF值的來源：

min(geneFDR$FDR) 
[1] 0 
max(geneFDR$FDR) 
[1] 0.009883703 

min(-log10(geneFDR$FDR)) 
[1] 2.00508 
max(-log10(geneFDR$FDR)) 
[1] Inf

如何是默認plot功能處理INF值不同於ggplot？

來源

2017-07-24 user8121557

一個更簡單的可重複的例子：'X < - C（0,1,2，Inf文件）''然後積（X）'和'ggplot（data.frame（X），AES （x = 1：4，y = x））+ geom_point（）' – thelatemail

看起來'ggplot'認爲圖的上邊界和下邊界（位於軸極限之外）是'Inf'和' - Inf'，而'plot'默認忽略'Inf'。 – neilfws

這似乎是一個可疑的設計選擇，因爲你可以用'ggplot（data.frame（x），aes（x = 1：4，y = x））+ geom_line（）'來結束，與數據實際表示的角度不同。 – thelatemail

嘗試

scale_y_continuous(oob=scales::discard)

來源

2017-07-24 07:41:04 baptiste

ggplot和plot如何處理inf值的不同？

回答

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