qsub python import

我第一次在羣集上運行作業。我用下面的命令來運行它：qsub python import

qsub -cwd -S /usr/bin/python myScript.py

我有開頭的Python腳本：

import time 
import anotherScript

的錯誤，我得到：

Traceback (most recent call last): 
    File "/opt/sge62/default/spool/hpc01/job_scripts/487174", line 11, in <module> 
    import anotherScript 
ImportError: No module named anotherScript

的anotherScript.py是在同一目錄作爲myScript.py。

我能做些什麼來解決這個問題？將不勝感激任何幫助

來源

2013-04-10 Jelena-bioinf

請注意，並非所有qsub實現都相同。我找不到'-cwd'選項，儘管大概它應該在當前工作目錄中運行進程，並且一切都應該工作......您可以'導入os;打印os.getcwd（）'並查看告訴你的信息。 – mgilson 2013-04-10 12:55:49

好吧，promlem由'sys.path.append（currentWorkingDirectory）'解決。但是，這絕對不是一個好方法。 – 2013-04-12 10:43:45

我很高興你明白了。隨意堆棧溢出讓你發佈這個答案。也許這對其他人來說可能會有所幫助。 – mgilson 2013-04-12 14:25:36

好了，問題解決了sys.path.append(currentWorkingDirectory)。但是，這絕對不是一個好方法。

來源

2013-04-26 12:31:32

qsub python import

回答

相關問題