使用gfortran編譯器構建TINKER軟件包

Question

我希望能夠跨過Mac OSX 10.6.8上的TINKER分子建模軟件包。可以在http://dasher.wustl.edu/ffe/找到關於如何使用gfortran（我正在使用的fortran編譯器）構建軟件包的文檔。這些說明都在guide.txt文件中（在TINKER Complete Distribution（GNU gzip，18.1 Mb）中提供），但我的能力水平很低，所以我可能會錯過一些東西。

TINKER編譯一堆單獨的包。我想編譯和調試多文件「分析」程序，但我幾乎沒有經驗編譯fortran或使用.make文件。

使用單線程序，這是容易做到

gfortran -g myprogram.f -o myprogram 
gdb myprogram 
break main 
run 

或類似的東西。我想知道是否有人在這裏可以看看源代碼構建指令，並告訴我編譯+調試analyze.f文件的過程（它是否仍然有必要？）

Answer 1

最簡單的方法是使用目錄'make'中的Makefile。只需將文件複製到「源」目錄並稍微調整即可。在Makefile的開頭有很多不同編譯器的設置，你只需要檢查只有gfortran設置沒有被註釋（用＃）。

基本上你需要去掉下面塊

F77 = /usr/bin/gfortran 
LIBS = 
F77FLAGS = -c 
OPTFLAGS = -O 
LIBFLAGS = -crusv 
LINKFLAGS = 

和評論所有其他（在我的情況下，英特爾Fortran編譯器，ifort，是默認值）。

，並在Makefile文件的最開始，你也應該插入的源代碼和安裝正確的路徑：

TINKERDIR = /Users/ponder/tinker 
BINDIR = $(TINKERDIR)/bin 
LINKDIR = /usr/local/bin 

一旦你有調整的Makefile源目錄，你只需要輸入

make all 

編譯整個包，並且

make rename 

在BINDIR目錄中安裝二進制文件。