比較和可視化序列

Question

組我有兩個組字母「AGTE」的字符串和乙，我想找到比較這些，看看他們是否在統計上類似的辦法。第一組A是現實世界觀察，B是預測。每組有400左右例如：

**A** 
GTAATEGTTTEAAA 
TTEAGE 
... 

**B** 
AGTEAAAAGT 
TAT 
GGATEAATGGGTEAATG 
.... 

我也想在某種程度上將它們想像成爲演示目的。你有什麼想法，我怎麼能做到這一點？

Answer 1

我建議你計算字符串之間的Levenshtein distance，然後你可以繪製這些字符串間的距離。較大的值表示更不相似的字符串。

如果您不想自己實施Levenshtein距離計算，請在文件交換中查看thesesubmissions。