R腳本和庫預加載？

我已經創建了一個R腳本，它需要首先加載一些庫。R腳本和庫預加載？

問題是腳本需要1.6秒來完成其計算（使用Linux命令「time」測量它多次），只需要0.7秒就可以加載庫！

該腳本運行頻率很高，因此庫加載的延遲幾乎佔實際工作負載的80％！

有沒有辦法讓庫預加載，以便每次腳本運行時都不會加載它們？

任何其他建議，以繞過這種緩慢？

#!/usr/bin/Rscript 

library(methods, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(MASS, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(RBGL, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(igraph, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(bnlearn, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(gRbase, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
library(gRain, quietly=TRUE, warn.conflicts = FALSE) 
.. 
..

來源

2012-03-30 Vangelis Tasoulas

Vangelis，我有類似的問題，你有沒有使用Rserve（）作爲駐地R實例，並從R客戶端連接到它？ – user1103294 2013-03-09 23:30:25

不，我還沒有嘗試過。這個腳本是作爲一個碩士論文的原型概念驗證，因此目前沒有必要提高速度。它被添加到我還沒有花時間的「未來工作」部分。 – 2013-03-10 14:58:57

如果你把你的腳本轉換爲包（你應該無論如何，在較長的運行...），那麼你可以只使用你從使用軟件包需要的符號Imports - 這是典型的比Depends所做的滿載要快一點。

所以關鍵是要

使用包
瞭解NAMESPACE
import正是您所需要的符號。

正交方法是不重新啓動，並保存時間---你可以使用Rserve作爲常駐[R實例，只需連接到它的R客戶端。可能更多的工作，雖然...

來源

2012-03-30 02:20:34

持久的R實例聽起來像是更快的方法，尤其是從長遠來看。它有多糟？ – sarnold 2012-03-30 02:45:46

我不知道你是否可以A）使用包函數將你的函數寫入一個環境，B）限定名字空間，C）字節編譯函數到環境中，D）保存環境，然後每次加載它腳本運行？您可以將它附加到會話中，使其與全局中的功能相同？ – Hansi 2012-03-30 07:28:34

感謝您的回答。將嘗試您的建議。我現在需要閱讀更多關於NAMESPACE和RServe的內容，因爲我之前對他們沒有任何線索。 – 2012-03-30 11:53:10

R腳本和庫預加載？

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