我正在使用R來對我命名爲'tissuedata'的矩陣進行聚類。我有一個用下面的代碼生成一個hclust對象:如何在R中打印一個hclust對象的行?
TissueDist<-dist(tissuedata, method="euclidean")
TissueClust<-hclust(TissueDist, method='complete')
現在我想同時保留集羣行的順序從TissueClust打印出該行的名稱。有什麼建議麼?
這裏是什麼樣的 'tissuedata' 矩陣可以包含一個例子:我不知道如果我理解問題的權利
Brain Bone Breast Lung Ovary Pancreas HeLa
17271422_17271984_ENSG00000026025 -3.266758 0.000000 -3.215719 -5.248721 0 -2.891329 -3.718194
17272608_17272709_ENSG00000026025 -4.304518 -4.560667 -3.359868 0.000000 0 -3.108627 -4.227678
17272632_17272709_ENSG00000026025 -4.188425 -4.444906 -3.243362 0.000000 0 -2.992122 -4.111259
17272649_17272709_ENSG00000026025 -3.984628 -4.338187 -3.104413 0.000000 0 -2.791452 -3.828157
17275586_17275681_ENSG00000026025 -3.278478 -3.932706 -2.903414 -4.480172 0 -2.781268 -3.423038
17276692_17276817_ENSG00000026025 -3.355184 -4.351640 -3.009279 0.000000 0 -3.231431 -4.194499
17276692_17276850_ENSG00000026025 -3.456211 -4.453457 -3.110306 0.000000 0 -3.332458 -4.294992
17277845_17277888_ENSG00000026025 -3.842749 -4.195861 -2.661506 0.000000 0 -2.373369 -3.436403
17277845_17277908_ENSG00000026025 -4.005683 -4.358526 -2.824233 0.000000 -1 -2.536096 -3.599131
你有一些樣本數據嗎? – Peter
這就是'tissuedata'矩陣的樣子。 – user2639056