我一直努力使自己的軟件包成爲可能。我按照上面的問題在how to develop package for layman的計算器上按照指令操作。以下是我在上一個問題之後工具的步驟。新鮮R對話在Windows/Linux中爲Mac創建軟件包
運行R代碼裏面
# random DNA function randDNA = function(n){ paste(sample(c("A", "C", "T", "G"), n, replace = TRUE), collapse = "") } # DNA to RNA function dna2rna <- function(inputStr) { if (!is.character(inputStr)) stop("need character input") is = toupper(inputStr) chartr("T", "U", is) } # complementary sequence function compSeq <- function(inputStr){ chartr("ACTG", "TGAC", inputStr) } # example data dnaseq1 <- c("ATTGTATCTGGGTATTTCCCTTAATTGGGGCCTTT") dnaseq2 <- c("TGGGGTAAACCCGGTTTAAAATATATATATTTTT") myseqdata <- data.frame(dnaseq1, dnaseq2) save(myseqdata, file = "myseqdata.RData")
Pefrom R中的以下任務
require(utils) package.skeleton(list = c("randDNA","dna2rna", "compSeq", "myseqdata"), name = "dnatool",environment = .GlobalEnv, path = "c:", force = FALSE)
編輯系統環境可變路徑在命令行窗口7
C:\Rtools\bin;C:\Rtools\perl\bin;C:\Rtools\MinGW\bin; C:\Program Files\R\R-2.14.2\bin\x64;
(類型
>path
以下來檢查路徑被適當地設定。複製步驟的文件夾dnatool(3),並把在名爲rpackage新的文件夾,現在將目錄更改到該文件夾(在DOS)
c: \ repackage> R CMD build dnatool c: \ repackage> Rcmd build dnatool
編輯:我有時讓dnatool.zip但其他時間dnatool.tar.gx
在命令行檢查包(DOS)
c: \ repackage> R CMD check dnatool
我能夠在Windows中將它打包爲「dnatool.zip」。
如何編譯爲MAC或unix源代碼?哪些步驟不同?
Unix source: dnatool.tar.gz
Mac OS X binary: dnatool.tgz
我需要Mac電腦做的。我有Linux的virtualbox和安裝Ubuntu的呢?
編輯:
我應該使用以下commad擺脫步驟(3)文件夾dnatool sourcode二進制?
$ tar -zcvf dnatool.tar.gz/home/dnatool
謝謝,你的意思是「dnatool.zip」可以用在unix環境中嗎? – jon 2012-04-21 13:13:10
「請注意,如果您將包裝上傳到CRAN,則所有包裝都將爲您完成。」什麼應該加載到CRAN?對於簡單的問題抱歉 – jon 2012-04-21 13:14:56
壓縮文件是一個Windows二進制文件,只需創建一個源碼分發(tar.gz),並且在Windows,Mac或Linux下應該沒問題。請注意,在這種情況下,用戶需要安裝構建工具。但是,在Linux下,通常情況下,在Mac和Windows下安裝它們非常容易。一旦你的軟件包在CRAN上(如果你計劃的話),所有這些問題都會消失,用戶可以使用'install.packages'來安裝它。 – 2012-04-21 13:16:06