cron無法運行R腳本

我有一個R腳本，可以從R或命令行運行得很好。它的操作非常簡單。它只需要一些定期更新的數據，進行一些分析，繪製一些圖並將其保存到磁盤。我想自動運行它，與數據更新同步，因此我試圖在cron作業下運行它。它一切都很好，直到它將圖像寫入磁盤。然後它告訴我它無法打開第一張圖片，並失敗。我嘗試了所有我能想到的東西：檢查運行目錄中的權限，確保cron正在運行，將我的cron命令從「R CMD BATCH」切換到「Rscript」。沒有任何工作。再次，腳本在R或命令行中運行得很好。任何人對我還能做什麼有什麼想法？（順便說一句，我也發現這個類似的問題在這個網站，但鑑於那裏的答案在我的具體情況沒有幫助。）cron無法運行R腳本

有問題的代碼似乎是：

png(file=nd_pic_image_names[1],height=720,width=720)

錯誤返回的是：

Error in X11(paste("png::", filename, sep = ""), g$width, g$height, pointsize, : 
unable to start device PNG 
Calls: png 
In addition: Warning message: 
In png(file = nd_pic_image_names[n], height = 720, width = 720) : 
unable to open connection to X11 display '' 
Execution halted

我不明白「X11」的東西。我沒有在代碼中的任何地方引用X11（），並且我不打算在打開（或試圖打開）我的PNG文件之前繪圖。謝謝。

來源

2012-09-18 bob.sacamento

它可能有助於從腳本中提供錯誤消息和相關的代碼片段。 – flodel

請參閱編輯以提問。 –

Bob，X11指的是「X」窗口系統，它比我們通常處理的計算機東西低幾層。它被'R'的'plot（）'函數調用以寫入屏幕。當然，'png（）'寫入文件而不是屏幕。請參閱Andrie的答案：http://stackoverflow.com/a/8322743/563329 – isomorphismes

開始簡單：

添加一個cronjob，簡單地執行一個命令，也許format(Sys.time())，通過RSCRIPT文件 - 主要是證明（自己），你可以運行的R腳本
將現有代碼轉換爲可以在命令行運行的R腳本。確保你沒有依賴於環境變量等pp
將你的腳本添加爲cronjob。如果失敗，則通過添加到1中創建的腳本來逐漸完成。

來源

2012-09-18 16:17:37

cron無法運行R腳本

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