2014-12-03 39 views
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我想將uniprot數據庫上傳到neo4j來創建圖形數據庫。 Uniprot數據庫以xml格式提供。我想將XML格式轉換爲CSV格式。 儘管有許多用於轉換的在線工具,但它們僅限於小文件大小。 任何人都可以在這方面幫助我嗎? 如Uniprot數據庫大小爲5.2 GB巨大的XML到CSV的轉換

由於提前 帕萬·庫馬爾Alluri

回答

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在Java中,我認爲使用的SAXParser可以解決這個問題,因爲的SAXParser並不需要所有的XML數據在內存中一次。

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同樣,您不需要將CSV保存在內存中,也可以將它寫出到文件中。 – Thilo 2014-12-03 06:23:11