從特定目錄中的python腳本運行bash命令

我正在嘗試編寫一個Python腳本來從多個目錄中的bash中遞歸運行一個程序，並在日誌文件中保存（現在只是顯示）輸出。從特定目錄中的python腳本運行bash命令

問題是，當我試圖從主目錄運行該應用程序，只是給它的輸入文件的完整路徑崩潰，所以我通常直接在包含輸入文件的目錄中運行它。我試圖用os.popen（）和pexpect來做到這一點，但我認爲這裏最合適的就是子進程。

我的代碼：

import subprocess, 
from subprocess import Popen, PIPE 

subprocess.Popen("$fp "+pcr+" "+dat, cwd=path+dirs[0], stdout=PIPE) 
print output.stdout.read()

其中PCR和DAT輸入文件的名稱。

當我嘗試運行它，我得到以下錯誤：

Traceback (most recent call last): 
File "file_ed.py", line 47, in <module> 
subprocess.Popen("$fp "+pcr+" "+dat, cwd=retval, stdout=PIPE) 
File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__ 
errread, errwrite) 
File "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child 
raise child_exception 
OSError: [Errno 2] No such file or directory

可能是什麼這個問題的原因，以及如何解決它？

來源

2015-08-08 Silneus

您正在嘗試訪問文件或運行不存在的命令。例如，可能沒有命令'$ fp'。有關在子進程中使用環境變量的信息，請參見[此問題]（http://stackoverflow.com/questions/26643719/python-exporting-environment-variables-in-subprocess-popen）。 –

運行一系列bash命令的最好方法是編寫一個bash腳本來完成它。你的方法是艱難的。 – msw

我認爲你的問題是，你想通過pcr和dat作爲程序的參數，你認爲空白會爲你做 - 但Python不是bash。只需使用一個數組，它應該工作：

subprocess.Popen([fp, pcr, dat], cwd=path+dirs[0], stdout=PIPE)

你得到了「沒有這樣的文件或目錄」的原因是：由於Python是尋找一個名爲"$fp "+pcr+" "+dat程序，即它假定空白（美元符號，除非你的意思是它是一種僞代碼佔位符）是程序名稱的一部分。錯誤告訴你沒有這樣的名字的程序。

但很難猜出您的意思，因爲您的代碼段不完整。我真的不知道什麼是$fp和pcr和dat的意思。

另請參閱子流程模塊文檔中的示例。

來源

2015-08-08 14:22:49 betterworld

對不起''fp dat'和'pcr'這個模棱兩可的問題。最後兩個是我說的字符串包含我想要運行的應用程序的輸入文件。 '$ fp'是bash中應用程序的符號鏈接，但我不認爲它會以這種方式工作，所以我將其更改爲完整路徑。我用pexpect解決了它：'child = pexpect.run（'/ usr/local/bin/FullProf_Suite/fp2k'+ pcr +''+ dat，logfile = sys.stdout，cwd = path + dirs [0]） – Silneus

'path'和'dirs [0]'只是形成我的工作目錄的路徑的字符串。感謝您的回覆！ – Silneus

從特定目錄中的python腳本運行bash命令

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