R：分拆和使用packrat快照的說明

Question

我使用packrat（v 0.4.8.-1）來創建一個快照以及與相應的R代碼一起的R軟件包依賴關係。我想向其他人提供R代碼和軟件包，以使我所做的工作（包括R環境）完全可重現。

我使用不同於我用來編寫R代碼並創建捆綁軟件的計算機來測試unbundling。我在R studio中打開了一個R代碼文件，並調用庫（packrat）來加載packrat（也是v 0.4.8-1）。然後，我打電話給packrat :: unbundle（bundle =「directory」，where =「directory」），它已成功解包。但隨後調用packrat :: restore（）給了我錯誤「這個項目還沒有被打包。運行'packrat :: init（）'到init packrat」。看起來init（）不應該是必須的，因爲我不是試圖創建一個新的快照，而是利用bundle中的快照。 Packrat頁面（https://rstudio.github.io/packrat/）和CRAN幾乎沒有提供關於分拆的文檔，以幫助解決這個問題，或者我可以將我的代碼的用戶指向說明（可能會熟悉R但可能沒有使用packrat）的用戶。

那麼，有人可以提供明確的分步驟說明，瞭解捆綁快照的用戶應該如何解包，然後使用保存的快照運行R代碼文件？

Answer 1

經過一番嘗試，我發現了一種似乎迄今爲止工作的方法。

我已經爲用戶提供了三個文件：

-tar.gz (packrat bundle file) 
-unbundle.R (R code file that includes a library statement to load 
the packrat library, and the unbundle command for the tar.gz file) 
-unbundle_readme.txt 

自述文件包含類似下面這些說明，到目前爲止，用戶已經能夠使用該軟件包的依賴關係運行R代碼裏面。 readme文件告訴用戶有關需求的信息（R，R studio，packrat，R軟件包開發先決條件（Rtools for Windows，XCode for Mac）），並將sessionInfo（）的輸出包括到R代碼在指令之後應使用的文檔R軟件包版本隨之而來。在下面的例子中，'code_folder'是指tar.gz文件中包含R.代碼和相關輸入文件的文件夾。

舉例說明鬆綁：

步驟1

保存，但不擴大/解壓縮，tar文件到一個目錄。 當使用除R或R studio 以外的程序解壓tar文件時，訪問保存的軟件包依賴關係 時出現問題的可能性更大。

如果tar文件已被擴大， tar文件重新保存到一個新的目錄，它不應該是一個相同 目錄擴展tar文件，或 展開tar文件的子目錄。

步驟2

保存unbundle.R在相同的目錄中tar文件

步驟3

打開unbundle.R，使用R工作室

步驟4

執行unbundle.R （這將創建一個子文件夾'code_folder'。 請注意，這一步可能需要運行5-15分鐘。）

步驟5

關閉R工作室

步驟6

導航到子文件夾 'cold_folder'

步驟7

打開，使用R工作室 A R腳本（軟件包庫應該對應於下面列出的軟件包 這表示R studio是acces唱所保存的包 依賴關係。）

步驟8

執行將R代碼，這將利用該項目包庫。 使用上述 步驟加載軟件包庫後，無需爲每個 腳本重新加載軟件包庫。 R studio將繼續訪問您在R Studio會話中打開的每個腳本的軟件包依賴項 。如果 隨後關閉R-studio，然後從 打開unbundle目錄中的腳本，則R studio應該仍然可以訪問 依賴項，而無需重新加載保存的包 快照。