錯誤awk命令的回聲管道輸送到WC -l

我有數百個包含類似於此行的文件的：錯誤awk命令的回聲管道輸送到WC -l

>34764998 Halalkalicoccus_jeotgali_B3 -132.6938 Halalkalicoccus 0.528 Halobacteriaceae 0.638 Halobacteriales 0.648 Halobacteria 0.706 Euryarchaeota 0.850

我對計數第5列的項數小於0.1， ... 0.95。我寫了一個bash腳本，它調用一個AWK命令來評估列值，然後將其轉換爲wc -l（見下文）。但是，我沒有正確安排我的$，'和括號。任何人都可以告訴我，我做錯了什麼？這可能不是最有效的方式，所以我歡迎提出建議，但我確實想知道我列出的代碼有什麼問題。

for fileName in 4440319.3_genus.txt 4440372.3_genus.txt 4440373.3_genus.txt 4440378.3_genus.txt 4440379.3_genus.txt 4440380.3_genus.txt 4440381.3_genus.txt 
do 
    echo $fileName 
    for number in 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 0.95 
    do 
     #NUM={awk '$5 < '$number' {print $5}' $filename | wc -l} 
     NUM={awk '$5 < $number {print $5}' $filename | wc -l} 
     #NUM=${awk '$5 < '$number' {print $5}' $filename | wc -l} 
     #NUM=${awk '$5 < $number {print $5}' $filename | wc -l} 
     echo $NUM 
    done 
done 
exit 0

所有的變化都會產生無效的選項錯誤，具體取決於哪些行未被註釋。

非常感謝。

來源

2014-01-23 cer

假設你正在使用sh或bash，這裏就是我想要做的：

NUM=`awk -v x=$number '$5 < x {print $5}' $fileName | wc -l`

一些解釋爲什麼這個工作，你的努力不起作用：

您需要執行管道並將其輸出存儲在變量NUM中。這就是爲什麼你需要管道周圍的反引號。
您的$number是一個shell變量。 Shell變量擴展不會發生在單引號內，因此awk腳本中的$number不會被替換爲您需要的數字。要解決這個問題，您可以使用雙引號將數字嵌入到正確的位置（由於awk腳本中的其他美元符號不會被擴展），因此會導致一些麻煩，或者您可以使用外部初始化的變量awk。這就是-v的論點。
最後但並非最不重要，您需要修復小寫'N'filename。

來源

2014-01-24 00:08:05 nickie

春天來了！是的，除了-v和x =的東西，我總是忘記它是'，不是'。非常感謝@nickie。完美的作品。 – cer

也@nickie，非常感謝你的解釋。 – cer

你不需要wc -l管，甚至不需要爲文件名的循環，試試這個：

awk -v n=0.95 '$5<n{a++}END{print a}' *_genus.txt

來源

2014-01-24 00:09:56 Kent

這是絕對正確的。 – nickie

@nickie有一個解決方案，但我很好奇你的，我正在運行它，我收到一個值，而不是40個值。我錯過了什麼？ – cer

您是否刪除了'wc -l'？ – nickie

這裏，我給了完整的腳本：

for fileName in 4440319.3_genus.txt 4440372.3_genus.txt 4440373.3_genus.txt 4440378.3_genus.txt 4440379.3_genus.txt 4440380.3_genus.txt 4440381.3_genus.txt 
do 
    echo $fileName 
    for number in 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 0.95 
    do 
     NUM={awk -v n=$number '$5<n{a++}END{print a}'} 
     echo "$NUM records is less than $number" 
    done 
done 
exit 0

來源

2014-01-24 01:01:29 BMW

錯誤awk命令的回聲管道輸送到WC -l

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