purl（）內knit（）重複標籤錯誤

Question

我正在編織一個.Rmd文件，並希望有兩個輸出：每次我運行鍼織HTML和一個purl'ed R腳本。這可以用下面的RMD文件來完成：

--- 
title: "Purl MWE" 
output: html_document 
--- 

```{r} 
## This chunk automatically generates a text .R version of this script when  running within knitr. 
input = knitr::current_input() # filename of input document 
output = paste(tools::file_path_sans_ext(input), 'R', sep = '.') 
knitr::purl(input,output,documentation=1,quiet=T) 
``` 

```{r} 
x=1 
x 
``` 

如果不命名塊，它工作正常，你會得到HTML和輸出.R每次運行時編織（）（或RStudio點擊針織） 。

但是，如果您命名該塊失敗。例如：

---

title: "Purl MWE" 
output: html_document 
--- 

```{r} 
## This chunk automatically generates a text .R version of this script when  running within knitr. 
input = knitr::current_input() # filename of input document 
output = paste(tools::file_path_sans_ext(input), 'R', sep = '.') 
knitr::purl(input,output,documentation=1,quiet=T) 
``` 


```{r test} 
x=1 
x 
``` 

它失敗：

Quitting from lines 7-14 (Purl.Rmd) 
Error in parse_block(g[-1], g[1], params.src) : duplicate label 'test' 
Calls: <Anonymous> ... process_file -> split_file -> lapply -> FUN -> parse_block 
Execution halted 

如果您註釋掉purl()調用，它將與指定塊的工作。因此，purl()調用也是如何命名塊的，這導致knit()認爲即使沒有重複時也有重複的塊名稱。

是否有辦法在.Rmd文件中包含purl()命令，以便生成兩個輸出（html和R）？還是有更好的方法來做到這一點？我的最終目標是使用新的rmarkdown::render_site()構建一個網站，每次編譯網站時都會更新HTML和R的輸出。

Answer 1

可以允許包括options(knitr.duplicate.label = 'allow')文件中重複的標籤如下：

title: "Purl MWE" 
output: html_document 
--- 

```{r GlobalOptions} 
options(knitr.duplicate.label = 'allow') 
``` 


```{r} 
## This chunk automatically generates a text .R version of this script when  running within knitr. 
input = knitr::current_input() # filename of input document 
output = paste(tools::file_path_sans_ext(input), 'R', sep = '.') 
knitr::purl(input,output,documentation=1,quiet=T) 
``` 


```{r test} 
x=1 
x 
``` 

此代碼未記錄的knitr網站上，但你可以跟蹤從Github上直接的最新變化：https://github.com/yihui/knitr/blob/master/NEWS.md