使用R解壓縮gz文件

我以前使用?unzip來使用R獲取壓縮文件的內容。這段時間，我很難從.gz文件中提取文件，該文件可以從here中找到。使用R解壓縮gz文件

我試過?gzfile和?gzcon，但一直沒有得到它的工作。任何幫助你可以提供將不勝感激。

2011-04-23 Btibert3

如果你真的想解壓縮文件，只需使用untar功能，不支持gzip的。例如爲：

untar('chadwick-0.5.3.tar.gz')

來源

2011-04-24 11:57:39 daroczig

這裏是一個工作的例子，可以幫助說明什麼gzfile()和gzcon()是

R> foo <- data.frame(a=LETTERS[1:3], b=rnorm(3)) 
R> foo 
    a  b 
1 A 0.586882 
2 B 0.218608 
3 C 1.290776 
R> write.table(foo, file="/tmp/foo.csv") 
R> system("gzip /tmp/foo.csv")    # being very explicit

現在，該文件被寫入，而不是隱式使用的file()，使用gzfile()：

R> read.table(gzfile("/tmp/foo.csv.gz")) 
    a  b 
1 A 0.586882 
2 B 0.218608 
3 C 1.290776 
R>

您指出的文件是一個壓縮的tar歸檔文件，據我所知，R本身沒有tar歸檔文件的接口。這些通常用於分發源代碼 - 例如R包和R源。

來源

2011-04-23 13:51:52

是否有可能與'FREAD {data.table}'這樣做呢？我到目前爲止嘗試沒有成功 – 2016-04-25 22:38:31

我不這麼認爲。檢查'fread'文檔。 – 2016-04-26 00:51:40

'fread（paste0（「zcat <」，PATH_TO_FILE））' – 2016-06-10 15:55:21

http://blog.revolutionanalytics.com/2009/12/r-tip-save-time-and-space-by-compressing-data-files.html

ř加入透明減壓某些種壓縮文件中的最新版本（2.10）。如果您使用bzip2，xvz或gzip壓縮文件，則可以將它們讀入R，就像它們是純文本文件一樣。你應該有適當的文件擴展名。

命令

myData <- read.table('myFile.gz')

#gzip壓縮文件有一個「GZ」擴展

將工作就像 'myFile.gz' 中的原始文本文件。

來源

2013-09-24 17:36:15 WCC

除非指定colClasses參數，否則它可以工作。如果你添加 myData < - read.table（'myFile.gz'，colClasses = c（「character」，「integer」））然後你會得到一個錯誤（從R 3.2.0開始）。廢話。 – Met 2015-06-12 16:58:51

要取消GZ R中一個文件，你可以做

library(R.utils) 
gunzip("file.gz")

來源

2015-05-09 19:25:39 RobertH

那就是我在找的東西。注意：'注意：默認的（remove = TRUE）行爲是在輸出文件被完全創建並關閉之後，輸入文件被刪除。「 - 見'？gunzip' – Rentrop 2016-12-27 10:33:50

哇，這似乎是錯誤的。 – wordsforthewise 2017-03-01 22:51:58

使用R解壓縮gz文件

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