bgzip目錄中的所有VCF文件？

Question

所以我一直在嘗試對100個VCF文件進行bgzip並行處理，但是雖然作業已經提交併且文件被創建，但肯定有錯誤。

到目前爲止，我一直在努力：

$for file in *.vcf 

> do 

> bsub /foo/bar/bgzip $file 

>> $file.gz 

什麼是做這種正確的方法是什麼？

提前致謝！

Answer 1

如果像我websearches建議，bgzip的工作方式爲gzip一樣，你不指定輸出文件：

for f in *.vcf; do 
    bsub bgzip "$f" 
done 

你也應該用雙引號變量的情況下，您的文件名有空間在其中。