重定向成果轉化爲文件

Question

我使用下面的腳本來提取一些軌跡文件中的數據並將數據轉儲到新文件。我可以使用指令「>」將結果重定向到一個文件中，但是我需要爲超過2000個文件執行此操作。爲了讓事情變得容易，我嘗試打開一個文件，讓python本身將結果導入文件。

爲了實現我添加一條線，在該地點，（##）中的代碼，以打開文件，如下所示。 另外我添加了一行來將結果導入文件，如下面的代碼所示，包含（###）。

#!/usr/bin/env python 
''' 
always put -- #!/usr/bin/env python -- at the shebang 
''' 

from Scientific.IO.NetCDF import NetCDFFile as Dataset 
import itertools as itx 


inputfile = "../traj-waters/waters1445-MD001-run1000.traj" 


for FRAMES in range(0,2): 
    frame = FRAMES 

    text_file = open("velo-Output.dat", "w") (##) 

    #inputfile = 'mdcrd' 
    ppp = inputfile 

    def grouper(n, iterable, fillvalue=None): 
     args = [iter(iterable)] * n 
     return itx.izip_longest(fillvalue=fillvalue, *args) 

    formatxyz = "%12.7f%12.7f%12.7f%12.7f%12.7f%12.7f" 
    formatxyz_size = 6 
    formatxyzshort = "%12.7f%12.7f%12.7f" 
    formatxyzshort_size = 3 

    #ncfile = Dataset(inpitfile, 'r') 
    ncfile = Dataset(ppp, 'r') 

    variableNames = ncfile.variables.keys() 
    #print variableNames 

    shape = ncfile.variables['coordinates'].shape 
    ''' 
    do the header 
    ''' 

    print 'title ' + str(frame) 
    print "%5i%15.7e" % (shape[1],ncfile.variables['time'][frame]) 


    ''' 
    do the velocities 
    ''' 
    try: 
     xyz = ncfile.variables['velocities'][frame] 
     temp = grouper(2, xyz, "") 

     for i in temp: 
      z = tuple(itx.chain(*i)) 
      if (len(z) == formatxyz_size): 
       print formatxyz % z 
       text_file.write('formatxyz\n' % z)) (###) 
      elif (len(z) == formatxyzshort_size): print formatxyzshort % z 


    except(KeyError): 

     xyz = [0] * shape[2] 
     xyz = [xyz] * shape[1] 
     temp = grouper(2, xyz, "") 

     for i in temp: 
      z = tuple(itx.chain(*i)) 
      if (len(z) == formatxyz_size): print formatxyz % z 
      elif (len(z) == formatxyzshort_size): print formatxyzshort % z 
      x = ncfile.variables['cell_angles'][frame] 
      y = ncfile.variables['cell_lengths'][frame] 
    text_file.close() 

但是，如果我運行下面的代碼，我會得到錯誤。

Traceback (most recent call last): 
File "./Nctorst-onlyVelo.py", line 73, in <module> 
    text_file.write(str('formatxyz\n' % z)) 
TypeError: not all arguments converted during string formatting 

因爲我是新手進入python我發現丟失糾正這個問題。

提前感謝您的幫助。 問候

Answer 1

無論你犯了一個錯字，或不知道如何string formating with replacement operator工作

行

text_file.write('formatxyz\n' % z)) (###) 

應寫入類似於前行

text_file.write(formatxyz % z + '\n') (###) 

你也應該期待使用Format String Syntax

Answer 2

print formatxyz % z < - 這裏是模運算

text_file.write('formatxyz\n' % z))（###）< ---這裏是字符串替換。不要使用

formatxyz\n' 爲字符串。

而是做到這一點：

text_file.write(str(formatxyz % z) + '\n') 

範例顯示了兩者的區別：

>>> formatxyz = 97 
>>> z = 10 
>>> formatxyz % z 
7 
>>> 'formatxyz' % z 
Traceback (most recent call last): 
    File "<stdin>", line 1, in <module> 
TypeError: not all arguments converted during string formatting 
>>> x = 'Hello world' 
>>> 'formatxyz is %s' % x 
'formatxyz is Hello world'