Dplyr選擇ENDS_WITH

我開始用DF，看起來像這樣：Dplyr選擇ENDS_WITH

sample_id  target_id length  eff_length est_counts tpm class 
1 SRR3884838C  (A)n  69   70   0  0.00000  0 
2 SRR3884838C  (AC)n  69   70   0  0.00000  0 
3 SRR3884838C  (AG)n  69   70   0  0.00000  0 
4 SRR3884838C  (AT)n  69   70   5  15.98870 0

我想用dplyr的選擇功能，以便只選擇以字母C端sample_ids，還有target_id和TPM。

示例數據：

> dput(droplevels(head(te,4))) 
structure(list(sample_id = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "SRR3884838C", class = "factor"), 
target_id = structure(1:4, .Label = c("(A)n", "(AC)n", "(AG)n", 
"(AT)n"), class = "factor"), length = c(69L, 69L, 69L, 69L 
), eff_length = c(70L, 70L, 70L, 70L), est_counts = c(0, 
0, 0, 5), tpm = c(0, 0, 0, 15.9887), class = c(0L, 0L, 0L, 
0L)), .Names = c("sample_id", "target_id", "length", "eff_length", 
"est_counts", "tpm", "class"), row.names = c(NA, 4L), class = "data.frame")

我嘗試使用以下內容：

teC <- select(te, (sample_id, ends_with("C")), target_id, tpm)

使我有sample_id，target_id和TPM，但不會只選擇sample_id的以C例如結尾：

 sample_id  target_id tpm 
9759 SRR3884843CxS Tigger15a 0.00000e+00 
9760 SRR3884843CxS Tigger16a 0.00000e+00 
9761 SRR3884843CxS Tigger16b 0.00000e+00

我在做錯選擇？我能夠毫無問題地處理教程網站的示例數據。

來源

2017-07-11 ZincFingers

什麼時候'sample_id'會以'C'結尾？你能提供一個例子嗎？ – CPak

第一個代碼塊有一個以C結尾而不是我的其他結尾（例如CxS）的例子，這有意義嗎？如果我需要澄清更多，請讓我知道。 – ZincFingers

select用於通過名稱保留變量（讀取：列），這就是您使用sample_id,target_id和tmp所做的事情。如果您想進一步內sample_id值過濾，再加入filter：

teC <- te %>% select(sample_id, target_id, tpm) %>% filter(grepl("C$", sample_id))

正則表達式"C$"將匹配以「C」結尾的字符串; "CxS$"將匹配以「CxS」結尾的字符串;和"(C|CxS)$"將匹配兩者。

來源

2017-07-11 20:55:47 cmaher

啊，我現在看到OP想要什麼...... – CPak

所以我不能使用select來獲取像這樣的列中的特定名稱：https：//www.r-bloggers.com/the-complete-catalog-of我想複製並粘貼你的答案，並得到錯誤 'filter_impl（.data，quo）中的錯誤：評估錯誤：'nchar（）'需要一個字符矢量' 我不熟悉使用％>％，所以我需要弄清楚。 – ZincFingers

其實這是不正確的 - 「endswith」是'select'的一個「幫助」函數（用於獲取具有特定名稱的列） - 我將更新此答案以正確匹配'sample_id'中的字符串 – cmaher

Dplyr選擇ENDS_WITH

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