在R Markdown中調試代碼

我一直在玩R Markdown，我真的很喜歡它，因爲在每次分析之後，我都需要編寫一個詳細說明結果的（Word）報告。使用R Markdown時，代碼和報告是相同的文檔，所以很容易記住，我選擇在代碼中的某個點執行分析B，因爲之前的分析A的結果。在R Markdown中調試代碼

但是，我無法在R Studio中設置R Markdown中的斷點，這嚴重限制了執行高效調試的可能性。這意味着最終我只能使用Markdown進行非常簡單的分析，其中R代碼非常簡單，無論是我不需要調試，或者我都可以手動進行調試。這是可以預料的，也就是衆所周知，R Markdown只能用於簡單的分析？或者有解決方案嗎？

來源

2017-03-15 DeltaIV

我不明白downvote的原因。問題很明顯：我無法在R Markdown中設置斷點（或者至少我無法）使用R Studio。那麼如何在R Markdown中調試複雜的代碼呢？ – DeltaIV

您可以在代碼中使用browser()來設置斷點。請參閱https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/205612627-Debugging-with-RStudio#debugging-in-r-markdown-documents

我發現將自定義函數寫入.R和source()它在Markdown中會更有用。然後，你獲得兩全其美的好處。

來源

2017-03-15 19:22:56

在R Markdown中，我通常有很多塊。你是否打算爲每個塊寫一個自定義函數？如果一個函數的結果依賴於另一個塊中的函數，那麼調試似乎會變得複雜。 – DeltaIV

不，我通常在幾個.R文件中編寫所有我正在使用的函數（例如，一個用於在許多分析中重複使用的常用自定義函數，另一個用於我爲此特定分析編寫的自定義函數），將文件第一個塊，並在隨後的塊中使用這些功能。 –

太棒了！謝謝：） – DeltaIV

在R Markdown中調試代碼

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