在匹配的子串上過濾rownames

Question

我有一個名爲IsomiR的列，我想選擇那些在此列的rownames中的第三個位置具有I-C的行。爲什麼我從我的命令中得到整數（0）？

IsomiR 
hsa-miR-200b-3p_AATACTGCCTGGTAATGATGACA 0 I-C t C 

grep("^(?:[^ ]+){3}I-C",topIsomiRSignAveExpr$IsomiR) 

Answer 1

因爲grep將返回產生匹配的x的元素索引的向量。指數=>數字。在你的特定情況下，你得到整數（0），因爲你的正則表達式不起作用。

如果你想過濾，我寧願建議使用grepl，例如，像這樣：

topIsomiRSignAveExpr <- topIsomiRSignAveExpr %>% 
    filter(grepl(".* .* I-C", IsomiR))