選擇一個特定的值,所以我有以下MCMC採樣 - !如何從列表蟒蛇
import numba
import numpy as np
import scipy.stats as stats
from scipy.stats import multivariate_normal
import seaborn as sns
import pandas as pd
import matplotlib.mlab as mlab
import matplotlib.pyplot as plt
import random
import math
def targ_dist2(x1,x2):
target2 = (mlab.bivariate_normal(x1, x2, 1.0, 1.0, -6, -6, 0.9) +
mlab.bivariate_normal(x1, x2, 1.0, 1.0, 4, 4, -0.9) +
mlab.bivariate_normal(x1, x2, 1.0, 1.0, 0.0, 0.0))/3
return target2
nSamples = 5000
propSigma = 2
x = np.zeros((nSamples+1,2))
xCurrent = stats.uniform.rvs(loc=-5, scale=10, size=2, random_state=None)
dims = range(2)
#INITIAL VALUES
t = 0
x[t,0] = xCurrent[0]
x[t,1] = xCurrent[1]
while t < nSamples:
t = t + 1
for iD in range(2):
xStar = np.random.normal(x[t-1,iD], propSigma)
alpha = min(1, (targ_dist2(xStar, x[t-1,iD!=dims])/targ_dist2(x[t-
1,iD], x[t-1,iD!=dims])))
#ACCEPT OR REJECT
u = random.uniform(0, 1)
if u < alpha:
x[t,iD] = xStar
else:
x[t,iD] = x[t-1,iD]
我的錯誤是在那裏我有=在alpha方程。基本上,我想在循環中選擇不等於值「iD」的「dims」中的值。因此,例如,如果循環通過值iD = 0工作,我想在上面的alpha方程中使用值1代替iD!= dims(如果有意義的話)。有沒有這樣做的一般方法?我希望延長該算法多個方面...
太謝謝你了!這似乎工作!你有沒有機會知道如何在多變量情況下擴展它?假設我們在10個維度上工作,例如? – tattybojangler
那麼在10天的情況下會返回什麼?目前我們有'(x,y)',我們返回未給出的值。如果我們有'(x,y,z,k ....)',那麼給出'x'它應該返回什麼? – jprockbelly