如何在使用perlbrew時安裝最新的BioPerl版本？

Question

我正在使用perlbrew，我想安裝最新的bioperl版本。我應該使用cpanm還是git？

如果git - 我是否照常安裝（AKA git clone ...然後製作和構建），還是我應該做特別的事情？

UPDATE

具體來說，我不知道我的理解，從BioPerl Using Git manual以下專家：

告訴perl到哪裏去找的BioPerl （假設你在 $ HOME簽出的代碼/ src;將其設置在您的 .bash_profile，.profile或.cshrc中）：

bash: $ export PERL5LIB="$HOME/src/bioperl-live:$PERL5LIB" 
tcsh: $ setenv PERL5LIB "$HOME/src/bioperl-live:$PERL5LIB" 

這是爲什麼necesary？

UPDATE 2

只需導出bioperl的克隆DIR不會影響所有的bp_***.pl腳本（其正常Build安裝後/usr/bin/下通常找到）。

我也嘗試切換到使用perlbrerw正確的perl的版本之後，從克隆的DIR打造，但隨後它運行CPAN命令來安裝一些依賴這似乎並不與perlbrew很好地工作（而不是cpanm）。

所以，我的問題仍然存在......

謝謝！

Answer 1

最新BioPerl總是要上GitHub，所以Git的答案在那裏。無論你想前沿是另一回事，但繼的BioPerl郵件列表一段時間後，我得到的感覺，開發商更傾向於說「install from GitHub」如果你有一個的BioPerl任何問題，特別是因爲most recent version on CPAN是從自那時以來，有很多發展。

至於安裝它，我不明白爲什麼你不能只是繼續前進，一旦你使用你的perlbrew perl做標準的git clone ...舞蹈，因爲這是perlbrew的點。 :-)

的問題更新日期：有關設置PERL5LIB Blurb的是，因爲有可能的BioPerl並不需要建立，一旦你通過git克隆它;它已經準備好直接使用。假設你還沒有將它克隆到@LIB的目錄中，你需要告訴Perl在哪裏找到它。無論您是否使用perlbrew，您都必須這樣做。

本質的過程是這樣的：

1. 從GitHub克隆的BioPerl。
2. 確保您使用的是安裝了Perl的perlbrew。
3. 根據BioPerl說明設置PERL5LIB環境變量。
4. 運行perl -MBio::Perl -le 'print Bio::Perl->VERSION;'以確保您使用的是剛剛簽出的BioPerl。

看着the sourcecode，＃4應該打印出1.006900，我想（或者可能是1.6.9，我永遠不能讓Perl版本號保持直線）。