如何在linux shell命令中運行自定義的R函數？

我想在名爲「run.plot.R」的R文件中使用linux在遠程HPC上運行自定義函數。如何在linux shell命令中運行自定義的R函數？

我鍵入linux命令：

R CMD run.plot.R

但似乎功能代碼不被R讀取文件呢。如何將函數文件加載到R然後運行它？

的r CMD BATCH run.plot.R'或'Rscript run.plot.R'？ –

我經常使用

R --vanilla -f <filename>

的--vanilla標誌用於確保在多個用戶之間一致的[R環境。根據您的需要，您可能會也可能不想使用它。

2014-04-04 03:28:54 ALiX

有三個選項：

Rscript run.plot.R

或

R CMD BATCH run.plot.R

所有這三個在非交互模式下運行。

如果你想以交互方式運行，要麼

R --file run.plot.R

或剛開始R過

那麼一旦R的運行

source("run.plot.R")

然而，上述所有的假設run.plot.R包含功能碼和 R調用來運行這些R函數。

最後，給出的文件名，任何情節是否或者可以生成b，將取決於遠程Linux服務器上運行如何，X是否超過轉發您所使用的連接等

2014-04-04 03:30:25

因此，在文件「run.plot.R」中我必須定義run.plot（）函數，並且在腳本文件的末尾我必須調用run.plot（）函數，對吧？（目前我只在.R文件中定義了函數） –

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