無法使用「＃」和空格使用read.table或read.csv在R

中讀取文件我有一個文件，其中第一行是一個標題。標題可以有空格和＃符號（也可能有其他特殊字符）。我試圖用read.csv函數read.table或讀取該文件，但它不斷拋出我的錯誤：無法使用「＃」和空格使用read.table或read.csv在R

undefined columns selected 

more columns than column names

我的製表符分隔chromFile文件看起來像：

Chromosome# Chr chr Size UCSC NCBI36/hg18 NCBIBuild36 NCBIBuild37 
1 Chr1 chr1 247199719 247249719 247249719 249250621 
2 Chr2 chr2 242751149 242951149 242951149 243199373

命令：

chromosomes <- read.csv(chromFile, sep="\t",skip =0, header = TRUE, )

我想首先尋找一種方法來讀取文件，因爲它沒有替換空間或＃與其他一些可讀的符號。

來源

2012-10-07 user1631306

從文檔（?read.csv）：

comment.char字符：包含單個字符或空字符串長度爲1的字符向量。使用「」來完全關閉註釋的解釋。

默認爲comment.char = "#"這會給您帶來麻煩。按照文檔，您應該使用comment.char = ""。

標題中的空格是另一個問題，正如mrdwab指出的那樣，可以通過設置check.names = FALSE來解決。

chromosomes <- read.csv(chromFile, sep = "\t", skip = 0, header = TRUE, 
         comment.char = "", check.names = FALSE)

來源

2012-10-07 18:26:27 flodel

添加'check.names = FALSE'，然後我認爲答案將是他們正在尋找的。 – A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1

它工作感謝..組合comment.char =「」和check.names = False – user1631306

無法使用「＃」和空格使用read.table或read.csv在R

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