在unix中重命名文件夾中的多個文件

我在文件夾中有一些多個文件我想縮短名稱。以下是輸入文件在unix中重命名文件夾中的多個文件

輸入

S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam 
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam 
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam 
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam 
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam 
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam 
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam 
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam 
S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam.bai 
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam.bai 
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam.bai 
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam.bai 
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam.bai 
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam.bai 
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam.bai 
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam.bai

輸出

S_12_O_319_K27ac.bam 
S_12_O_319_K27me3.bam 
S_12_O_319_K4me1.bam 
S_12_O_319_K4me3.bam 
S_14_AS_11_K27ac.bam 
S_14_AS_11_K27me3.bam 
S_14_AS_11_K4me1.bam 
S_14_AS_11_K4me3.bam 
S_12_O_319_K27ac.bam.bai 
S_12_O_319_K27me3.bam.bai 
S_12_O_319_K4me1.bam.bai 
S_12_O_319_K4me3.bam.bai 
S_14_AS_11_K27ac.bam.bai 
S_14_AS_11_K27me3.bam.bai 
S_14_AS_11_K4me1.bam.bai 
S_14_AS_11_K4me3.bam.bai

請注意，我的文件有兩個不同的擴展，一個是* .bam另一個是* .bam.bai。我想立刻重新命名它們以縮短名稱。從中刪除部分_S12843.sorted。請注意，這是第5個下劃線，而_S12843後面的數字對於不同的文件是不同的。只有類似的模式是字符串sorted。所以想截斷整個部分來縮短名稱。我怎樣才能用bash或者重命名或者sed來實現。任何幫助，將不勝感激。我能夠刪除字符串與排序但不是數字。

來源

2016-03-16 vchris_ngs

[批量使用bash重命名]可能的複製（http://stackoverflow.com/questions/602706/batch-renaming-with-bash） – n00dl3

使用rename工具，你可以這樣做：

rename 's/_[^_.]+\.sorted//' *.sorted.*

如果沒有rename不要再使用此for循環：

for f in *.sorted.*; do 
    mv "$f" "${f/_S[[:digit:]]*.sorted}" 
done

來源

2016-03-16 11:18:43 anubhava

他們兩人的作品，因爲它消耗更少的時間，所以更喜歡循環中的一個。我沒有新的這個'[：digit：]'的東西。你能向我解釋一次嗎？ –

'[[：digit：]]'是POSIX屬性，用於匹配全局或正則表達式中的數字[0-9]' – anubhava

嗯好了唯一的問題是確定'_S'理想情況下它也可以工作'for f在* .sorted。*中;做mv「$ f」「$ {f/_S [[0-9]] *。sorted}」;完成' –

這可能爲你工作（GNU SED）：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/e' file

或者：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/' file | shell

其中shell可能是bash等

來源

2016-03-16 15:11:32 potong

在unix中重命名文件夾中的多個文件

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