2013-03-19 78 views
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在我的Linux環境(Redhat)上安裝TPP軟件時遇到了一些問題。錯誤信息顯示如下:在Linux上安裝Trans-Proteomic Pipeline(TPP)4.6.1 Redhat

perl -c -I ../../build/RedHat-x86_64 ../../build/RedHat-x86_64/tpp_gui.pl 
Can't locate IO/Compress/Zip.pm in @INC (@INC contains: ../../build/RedHat-x86_64 /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/site_perl /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.7/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.6/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.5/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.7 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.6 /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.5 /usr/lib/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/5.8.8 .) at ../../build/RedHat-x86_64/tpp_gui.pl line 16. 

BEGIN failed--compilation aborted at ../../build/RedHat-x86_64/tpp_gui.pl line 16. 
make[1]: *** [../../build/RedHat-x86_64/tpp_gui.pl] Error 2 
make[1]: *** Deleting file `../../build/RedHat-x86_64/tpp_gui.pl' 
make[1]: Leaving directory `/root/TPP-4.6.1/trans_proteomic_pipeline/src/perl_paths' 
make: *** [perl_paths] Error 2 

有人可以幫我解決這個問題嗎?我迫切希望現在安裝並運行TPP。 在此先感謝!

回答

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從你缺少的Perl模塊,IO ::壓縮::郵編您系統中的錯誤信息,你應該首先安裝Perl模塊,然後再有另一個嘗試

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我輸入了命令perl -v,它顯示了perl v5.8.8作爲當前安裝的版本。 – 2013-03-19 06:36:45

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安裝的Perl並不意味着所需的Perl模塊IO :: Compress :: Zip已經安裝,您可以參考以下鏈接瞭解如何安裝Perl模塊:http://www.perlmonks.org/index.pl? node_id = 128077 – poiu2000 2013-03-19 06:53:55

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Bravo!這正是問題所在。謝謝! – 2013-03-19 08:05:22

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可以使用泊塢窗機,我們最近創建這裏:https://github.com/BioDocker/TPP-4.8.0,我們正在維護那些容器,隨後可以隨時與團隊聯繫。

Regards

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鏈接傾向於改變或失蹤,您能否解釋一些內容或在此處引用? – abarisone 2015-05-29 11:10:02

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biodocker允許您只安裝TPP碼頭機,並且可以像使用普通的命令行安裝 – ypriverol 2016-03-24 23:11:41