如何選擇和上傳python文件

-1

我正在編寫一個程序，它會詢問用戶想要讀取的文本文件，然後開始讀取用戶輸入的任何文件名。這是我到目前爲止：如何選擇和上傳python文件

import sys 
import os 
import re 

#CHOOSE FILE 
print "Welcome to the Parsing Database" 
raw_input=raw_input("enter file name to parse: ") 

#ASSIGN HEADERS AND SEQUENCES 
f=open("raw_input", "r") 
header=[] 
sequence=[] 
string="" 
for line in f: 
    if ">" in line and string=="": 
     header.append(line[:-2]) 
    elif ">" in line and string!="": 
     sequence.append(string) 
     header.append(line[:-2]) 
     string="" 
    else: 
     string=string+line[:-2] 
sequence.append(string)

前兩行工作，但然後它說它無法找到我輸入的文件讀取。請幫忙！謝謝。

來源

2016-08-03 Gia Constantina

解析FASTA文件;）什麼是你的錯誤，或者特定問題？ –

您不應該使用'raw_input'作爲變量名稱。另外，您不是在問您需要什麼幫助，也不會提及您是否有任何錯誤/障礙。 – Harrison

'IOError：[Errno 2]沒有這樣的文件或目錄：'raw_input''應該已經告訴你問題是什麼，你試圖打開一個名爲''raw_input''的文件而不是使用上面那行代碼的變量。 –

關閉我的頭頂，我認爲f = open("raw_input", "r")需求是f=open(raw_input, "r")，因爲你試圖引用包含的變量raw_input字符串，而不是試圖打開一個名爲的raw_input文件。你也應該把變量的名字改爲更易讀的名字，因爲raw_input()是一個在你的代碼中使用的函數，也是一個變量，這使得它很難閱讀。您的代碼中是否還有其他特定的問題？

來源

2016-08-03 17:34:37

感謝那是我的問題我有引號，它使我困擾 –

有沒有命名它raw_input真正的問題，因爲函數是raw_input（），但當然是更好地創建命名空間變量像file_raw_input或任何其他未採取。 – erm3nda

@Gia Consantina您能否請您將我的答案標記爲已接受然後 –

f=open("raw_input", "r")

「的raw_input」是純字符串。你必須參考raw_input。

此外，如果您不使用.read()和open()方法，則無法解析它們。閱讀來自raw_input給出文件行可以做這樣做：任何機會

import sys 
import os 
import re 

#CHOOSE FILE 
print "Welcome to the Parsing Database" 
raw_input_file=raw_input("enter file name to parse: ") 

#ASSIGN HEADERS AND SEQUENCES 
testfile = open(raw_input_file, "r") 
secuence = [] 
for line in testfile.read().splitlines(): 
    secuence.append(line) 
for i in secuence: 
    print i 
testfile.close()

來源

2016-08-03 18:00:08 erm3nda

如何選擇和上傳python文件

回答

相關問題