R包：在pkg/R和pkg/src文件夾中使用自定義文件/目錄結構

我正在寫一個R包，它的大小開始增長，所以真的很感謝在文件夾pkg/R /和（尤其是）在pkg/src /中。R包：在pkg/R和pkg/src文件夾中使用自定義文件/目錄結構

例如，假設我有一些類型A的算法的兩個族和一些類型B的函數以及一個主入口點。理想的情況是R /或SRC /文件夾會被安排如下：

的typeA/
- algorithms1/
  - algo11.ext
  - ...
- algorithms2/
  - algo21.ext
  - ...
的TypeB/
- function1.ext
- ...
main.ext

在{R 「EXT」，cpp，c，f，...}和潛在的兩個具有相同名稱的文件。

可能嗎？如果是的話，我該怎麼做？

在此先感謝！

[2012-12-31]編輯：一個想法是寫幾個腳本 - 說不定內部另一條R包 - 到（未）變平的結構化包裝用於測試或擴散。但是可能有更好的解決方案，所以我會稍微等一下。

來源

2012-12-20 BenjaminAuder

你可能？能夠在'src /'中使用自定義的Makefile。你有沒有搜索R擴展手冊？我認爲重組'R /'會更困難。 –

我試圖在src /中使用自定義的Makefile，但雖然它在命令行中運行良好，但在使用R CMD INSTALL（「沒有規則構建myfile.o所需的目標'myfolder/myfile.c'」）時失敗。我只發現這個關於子目錄組織http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Package-subdirectories的段落，並沒有看到任何有用的內容。也沒有什麼谷歌搜索一會兒，所以我在這裏嘗試。 – BenjaminAuder

作爲「Writing R擴展」手冊indicates here，pkg/src下的Makevars文件允許爲C/C++/Fortran代碼嵌套子文件夾。（例如參見RSiena包）。

但是，我沒有發現有關pkg/R中的自定義結構的任何內容。所以，我寫了一個小封裝（可用的，儘管需要改進），其完成以下任務：

加載/卸載具有封裝（潛在的）下的pkg/R嵌套文件夾
啓動R和/或C單元在其上的測試[基本框架，要被替換（例如RUnit和檢查）]
導出包要CRAN兼容（弄平R代碼裏面，生成Makevars文件）

我將在這裏，如果其鏈接它達到可發佈狀態。（目前我可以通過電子郵件發送）。

來源

2013-01-09 17:42:30 BenjaminAuder

你有沒有在包裝上取得進展？ –

R包：在pkg/R和pkg/src文件夾中使用自定義文件/目錄結構

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