更換色譜柱爲設計格式

我有這樣的更換色譜柱爲設計格式

Hei-3_ctg7180000009945 pan gene 1 13249 . . . ID=Hei-3_ctg7180000009945;Name=Hei-3_ctg7180000009945 
Hei-3_ctg7180000009946 pan gene 1 587 . . . ID=Hei-3_ctg7180000009946;Name=Hei-3_ctg7180000009946

一列，我希望把它想：

Hei-3_ctg7180000009945 pan gene 1 13249 . . . ID=Hei-3_ctg7180000009945;Name=Hei-3_ctg7180000009945 
Hei-3_ctg7180000009945 pan mRNA 1 13249 . . . ID=mHei-3_ctg7180000009945;parent=Hei-3_ctg7180000009945 
Hei-3_ctg7180000009945 pan exon 1 13249 . . . ID=eHei-3_ctg7180000009945;parent=mHei-3_ctg7180000009945

任何建議，我可以很容易地做到這一點所以基本上我將打印每排三次。第一行與輸入相同。第二行將基因改變爲mRNA以及最後一列的改變。等第三欄。

這是我在python中試過的。但我試圖讀取每個元素，但我不知道如何修改某些元素？

with open('10_pan.gff3') as f: 
for line in f: 
     lines1 = line.rstrip('\n').split(' ') 
     ll = line.split('\t') 
     #print (ll) 
     print(lines1)

來源

2016-10-04 胡海飛

你必須向我們展示你試過已經什麼。不在這裏做你的工作，我們？ –

嘗試：'column -t filename' – sat

第二行成爲兩行的基礎是什麼？爲什麼列值從'587'變成'13249'和'gene'變爲'mRNA'等 – Sundeep

非常模糊的問題，但（在這種情況下5）固定長度打印您可以使用

print("{:5}".format(123)) 
print("{:5}".format(12345))

產量

123 
12345

來源

2016-10-04 09:46:06

更換色譜柱爲設計格式

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