'模塊' 對象不是可調用 - Bio.IUPAC

Question

當我嘗試，

from Bio.Alphabet import IUPAC 
from Bio import Seq 
my_prot = Seq("AGTACACTGGT", IUPAC.protein) 

爲什麼我會遇到以下錯誤：

TypeError: 'module' object is not callable 

PS：這是來自BioPython的食譜爲例

Answer 1

在BioPython源代碼中的「SEQ」級位於路徑「/Seq/Seq.py」的文件「Seq.py」

在

含義......你需要輸入序列（文件），這意味着它的「模塊」，然後調用類的「序列」中的「模塊」「序列」

那麼試試這個：

from Bio.Alphabet import IUPAC 
from Bio import Seq 
my_prot=Seq.Seq("AGTACACTGGT",IUPAC.protein) 

如果你曾經在Python感到困惑，你在呼喚你可以做到這一點你導入什麼：

import Bio.Seq 
print type(Bio.Seq) 
>>> <type 'module'> 
print type(Bio.Seq.Seq) 
>>> <type 'classobj'> 

Answer 2

本給了一個很好清晰的答案解釋問題。我猜你複製的例子錯，

>>> from Bio.Seq import Seq 
>>> from Bio.Alphabet import IUPAC 
>>> my_prot = Seq("AGTACACTGGT", IUPAC.protein) 
>>> my_prot 
Seq('AGTACACTGGT', IUPACProtein()) 
>>> my_prot.alphabet 
IUPACProtein() 

至少，這就是它現在說http://www.biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html

注意的是，混亂的原因就可以避免了Biopython使用序列（小寫）的模塊，和Seq（標題大小寫） - 這是現在推薦的Python實踐，請參閱http://www.python.org/dev/peps/pep-0008/