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我設法根據一些樣本基因表達數據生成熱圖,並根據基因表達水平爲每個細胞分配填充。我將填充映射到colorbrewer刻度,例如:d3.js熱圖圖例
var z = d3.scale.log().base(2).domain([min, max]).range([0,1]),
fills = colorbrewer.RdBu[6];
heatmapFill = d3.scale.linear().domain(d3.range(0, 1, 1.0/(fills.length - 1))).range(fills);
…它對我來說工作得很好。不過,我將這些填充分配給附帶的圖例遇到了問題,該圖例填充了#NaNNaNNaN
。
// Get data
svg.selectAll('.tile')
.data(data.melted)
.enter()
.append('rect')
.attr({
'x': function(d) { return x(d.condition); },
'y': function(d) { return y(d.geneID); },
'fill': function(d) { return heatmapFill(z(d.value)); },
'width': x.rangeBand(),
'height': y.rangeBand()
});
// Add a legend for the color values.
var legend = svg.selectAll(".legend")
.data(z.ticks())
.enter()
.append("g")
.attr({
'class': 'legend',
'transform': function(d, i) {
return "translate(" + (i * 40) + "," + (height + margin.bottom - 40) + ")";
}
});
legend.append("rect")
.attr({
'width': 40,
'height': 20,
'fill': z // Problem likely to be arising from here
});
根據我的理解,似乎我無法取出填充物的價值,基於z的值。
下面是完整的小提琴:http://jsfiddle.net/teddyrised/jLxbawhz/2/
如果我選擇不映射我的表達水平對一個在ColorBrewer規模,而只是一個開始和結束的顏色,腳本工作正常(http://jsfiddle.net/teddyrised/jLxbawhz/3/):
// Scale
var z = d3.scale.log().base(2).domain([min, max]).range(['white','steelblue']);
// Get data
svg.selectAll('.tile')
.data(data.melted)
.enter()
.append('rect')
.attr({
'x': function(d) { return x(d.condition); },
'y': function(d) { return y(d.geneID); },
'fill': function(d) { return z(d.value); },
'width': x.rangeBand(),
'height': y.rangeBand()
});
// Add a legend for the color values.
var legend = svg.selectAll(".legend")
.data(z.ticks())
.enter()
.append("g")
.attr({
'class': 'legend',
'transform': function(d, i) {
return "translate(" + (i * 40) + "," + (height + margin.bottom - 40) + ")";
}
});
legend.append("rect")
.attr({
'width': 40,
'height': 20,
'fill': z
});
因爲忽略了這個非常簡單的解決方案,所以我在嘲笑我自己。 d3確實有一個非常陡峭的學習曲線,仍然很難理解它 - 而且你有很大的幫助。謝謝 :) – Terry