線程「main」中的異常java.lang.OutOfMemoryError：超出GC開銷限制

Question

我無法運行我的進程。它提供了以下異常：「異常線程‘main’java.lang.OutOfMemoryError：Java堆空間」

java -Xms32m -Xmx516m FilteringSNP_genus Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space at java.util.Arrays.copyOf(Arrays.java:2882) at java.lang.AbstractStringBuilder.expandCapacity(AbstractStringBuilder.java:100) at java.lang.AbstractStringBuilder.append(AbstractStringBuilder.java:515) at java.lang.StringBuffer.append(StringBuffer.java:306) at java.io.BufferedReader.readLine(BufferedReader.java:345) at java.io.BufferedReader.readLine(BufferedReader.java:362) at FilteringSNP_genus.main(FilteringSNP_genus.java:65)

我已經嘗試了不同的內存使用的配置，如：

java -Xms32m -Xmx1024m FilteringSNP_genus

卻一直沒有工作，並增加了-XmxVALUE給予了GC overheadlimit超過例外：

Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded at java.lang.String.substring(String.java:1940) at java.util.StringTokenizer.nextToken(StringTokenizer.java:335) at FilteringSNP_genus.main(FilteringSNP_genus.java:77)

任何人都可以提供一些線索，以解決這一問題？

感謝

Answer 1

我已經找到了GC會放棄，如果時間過長查找內存，即使內存居然有。最簡單的問題是內存大部分是虛擬的，這比實際的內存慢得多。另外，如果內存過於分散，GC可能需要一些時間才能找到所需的空間。如果你正在分配大量的記憶，那可能會使情況變得更糟。像GC這樣的問題可能是間歇性的，當GC有足夠的時間清理房屋並保持一切安排好，並且在超載時保持不變，這樣的問題可以是間歇性的。我的猜測是，在你的情況下，你要麼有分頁問題，​​要麼你的內存塊太大，太大。

解決方案：獲得更多的真實內存（如果分頁是問題）。使用更少的內存。使用較小的內存。數組是處理數字的最快方法，但帶指針的數據結構使GC的生活更輕鬆。如果你可以想出一個方法來使用更小的數組（或沒有數組），那就這樣做。

它應該有可能得到一個適當的64位系統（計算機和JVM）與8GB或更多的內存，所以你可以忽略和忘記這個問題，但我還沒有聽說過任何人這樣做。 （並且內存使用擴大以填充可用內存......）

Answer 2

爲了方便起見，我會冒險猜測您正在從文件或套接字讀取數據，並且使用readLine()而不考慮其含義。改爲嘗試reading into a char[] buffer。

或者，您正在閱讀線路並在內存中存儲對它們的嚴格引用，所以一旦您閱讀足夠的內容，您顯然會用完空間。

對於GC開銷誤差，根據本發明的Oracle JVM article： 「並行收集器將拋出一個OutOfMemoryError如果太多的時間被消耗垃圾收集：如果總時間的98％以上的垃圾收集中花費並且只有不到2％的堆被恢復，則會拋出OutOfMemoryError。「