2011-06-30 154 views
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我已經在R(2.13.0)中加載了paleoTS並試圖使用fit3models.joint函數,但是不能。我嘗試重新安裝,但它確保我paleoTS已經在那裏!幫助讚賞:爲什麼paleoTS功能不起作用?

Error: could not find function "fit3models.joint" 
> utils:::menuInstallPkgs() 
Warning: package 'paleoTS' is in use and will not be installed 

回答

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還沒有足夠的信息。我看到沒有證據表明fit3models.jointpaleoTS包中的函數:你的意思是fit3models ...?或fit3models(...,method='Joint')(基於在實例?fit3models

install.packages("paleoTS") 
library("paleoTS") 
ls(pos=2) 
[1] "add.OU.curves"   "akaike.wts"   "as.paleoTS"   
[4] "as.paleoTSfit"   "cat.paleoTS"   "compareModels"   
[7] "fit3models"   "fitGpunc"    "fit.sgs"    
[10] "IC"     "ln.paleoTS"   "logL.covTrack"   
[13] "logL.GRW"    "logL.joint.GRW"  "logL.joint.OU"   
[16] "logL.joint.punc"  "logL.joint.punc.omega" "logL.joint.Stasis"  
[19] "logL.joint.URW"  "logL.Mult"    "logL.Mult.covTrack" 
[22] "logL.punc"    "logL.punc.omega"  "logL.SameMs"   
[25] "logL.SameVs"   "logL.sgs"    "logL.sgs.omega"  
[28] "logL.Stasis"   "logL.URW"    "LRI"     
[31] "lynchD"    "mle.GRW"    "mle.Stasis"   
[34] "mle.URW"    "opt.covTrack"   "opt.covTrack.Mult"  
[37] "opt.GRW"    "opt.GRW.shift"   "opt.joint.GRW"   
[40] "opt.joint.OU"   "opt.joint.punc"  "opt.joint.Stasis"  
[43] "opt.joint.URW"   "opt.punc"    "opt.RW.Mult"   
[46] "opt.RW.SameMs"   "opt.RW.SameVs"   "opt.sgs"    
[49] "opt.Stasis"   "opt.URW"    "ou.M"     
[52] "ou.V"     "plot.paleoTS"   "pool.var"    
[55] "read.paleoTS"   "shift2gg"    "shifts"    
[58] "sim.covTrack"   "sim.GRW"    "sim.GRW.shift"   
[61] "sim.OU"    "sim.punc"    "sim.sgs"    
[64] "sim.Stasis"   "split4punc"   "std.paleoTS"   
[67] "sub.paleoTS"   "test.var.het"   
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感謝尋找答覆。那麼它工作在Mac上有R 2.8.0,所以我想這是頁面上。亨特和卡拉諾(2010)狀態253:「這三個模型可以是配合和使用從paleoTS包適當 功能相比: fit3models.joint(cantiusL) fit3models.joint(cantiusLW) 來自這兩個函數調用的輸出 總結在表2對於m1長度來說,方向 演進值得的模型支持比隨機遊走模型 顯着更多(更高的對數似然,更低的 AICC)。「 –

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該軟件包在過去的兩年中可能已經發生了變化(2.8.0版本是2.5年,2010年發佈的一篇文章可能在2009年已經編制完成)。通過'fit3models'閱讀給你什麼線索嗎?我強烈懷疑'fit3models(cantiusL,method =「Joint」)'將等同於上面指定的第一個命令... –

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乾杯。這太棒了 - 看起來確實是一樣的。然而,它沒有做的是打印模型參數。在幫助頁面http://127.0.0.1:25160/library/paleoTS/html/fit3models.html它說:「如果silent = TRUE,一個列表返回元素'modelFits'具有相同的數據框,再加上一個元素'參數「與所有參數估計的子元素」。,但沉默= TRUE似乎停止所有輸出(你期望從「沉默」!)。 –

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