爲什麼paleoTS功能不起作用？

我已經在R（2.13.0）中加載了paleoTS並試圖使用fit3models.joint函數，但是不能。我嘗試重新安裝，但它確保我paleoTS已經在那裏！幫助讚賞：爲什麼paleoTS功能不起作用？

Error: could not find function "fit3models.joint" 
> utils:::menuInstallPkgs() 
Warning: package 'paleoTS' is in use and will not be installed

來源

2011-06-30 Roland Sookias

還沒有足夠的信息。我看到沒有證據表明fit3models.joint是paleoTS包中的函數：你的意思是fit3models ...？或fit3models(...,method='Joint')（基於在實例?fit3models？

install.packages("paleoTS") 
library("paleoTS") 
ls(pos=2) 
[1] "add.OU.curves"   "akaike.wts"   "as.paleoTS"   
[4] "as.paleoTSfit"   "cat.paleoTS"   "compareModels"   
[7] "fit3models"   "fitGpunc"    "fit.sgs"    
[10] "IC"     "ln.paleoTS"   "logL.covTrack"   
[13] "logL.GRW"    "logL.joint.GRW"  "logL.joint.OU"   
[16] "logL.joint.punc"  "logL.joint.punc.omega" "logL.joint.Stasis"  
[19] "logL.joint.URW"  "logL.Mult"    "logL.Mult.covTrack" 
[22] "logL.punc"    "logL.punc.omega"  "logL.SameMs"   
[25] "logL.SameVs"   "logL.sgs"    "logL.sgs.omega"  
[28] "logL.Stasis"   "logL.URW"    "LRI"     
[31] "lynchD"    "mle.GRW"    "mle.Stasis"   
[34] "mle.URW"    "opt.covTrack"   "opt.covTrack.Mult"  
[37] "opt.GRW"    "opt.GRW.shift"   "opt.joint.GRW"   
[40] "opt.joint.OU"   "opt.joint.punc"  "opt.joint.Stasis"  
[43] "opt.joint.URW"   "opt.punc"    "opt.RW.Mult"   
[46] "opt.RW.SameMs"   "opt.RW.SameVs"   "opt.sgs"    
[49] "opt.Stasis"   "opt.URW"    "ou.M"     
[52] "ou.V"     "plot.paleoTS"   "pool.var"    
[55] "read.paleoTS"   "shift2gg"    "shifts"    
[58] "sim.covTrack"   "sim.GRW"    "sim.GRW.shift"   
[61] "sim.OU"    "sim.punc"    "sim.sgs"    
[64] "sim.Stasis"   "split4punc"   "std.paleoTS"   
[67] "sub.paleoTS"   "test.var.het"

來源

2011-06-30 19:42:56

感謝尋找答覆。那麼它工作在Mac上有R 2.8.0，所以我想這是頁面上。亨特和卡拉諾（2010）狀態253：「這三個模型可以是配合和使用從paleoTS包適當功能相比： fit3models.joint（cantiusL） fit3models.joint（cantiusLW）來自這兩個函數調用的輸出總結在表2對於m1長度來說，方向演進值得的模型支持比隨機遊走模型顯着更多（更高的對數似然，更低的 AICC）。「 –

該軟件包在過去的兩年中可能已經發生了變化（2.8.0版本是2.5年，2010年發佈的一篇文章可能在2009年已經編制完成）。通過'fit3models'閱讀給你什麼線索嗎？我強烈懷疑'fit3models（cantiusL，method =「Joint」）'將等同於上面指定的第一個命令... –

乾杯。這太棒了 - 看起來確實是一樣的。然而，它沒有做的是打印模型參數。在幫助頁面http://127.0.0.1:25160/library/paleoTS/html/fit3models.html它說：「如果silent = TRUE，一個列表返回元素'modelFits'具有相同的數據框，再加上一個元素'參數「與所有參數估計的子元素」。，但沉默= TRUE似乎停止所有輸出（你期望從「沉默」！）。 –

爲什麼paleoTS功能不起作用？

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