glmmADMB中的新bug？ VarCorr無法找到rdig

Question

我認爲這是一個新引入的bug。至少，它竊聽了以前的工作代碼。

library(glmmADMB) 
epil2$subject <- factor(epil2$subject) 
fm <- glmmadmb(y~Base*trt+Age+Visit+(Visit|subject), 
      data=epil2, family="nbinom") 
VarCorr(fm) 

產生以下錯誤：

Error in glmmADMB::VarCorr(fm) : 
    could not find symbol "rdig" in environment of the generic function 

VarCorr從nlme仍然正常工作：

library(nlme) 
nlme::VarCorr(fm) ##WORKS 
glmmADMB::VarCorr(fm) ##Still doesn't work. 

這是我的系統的系統信息是否有幫助：

> sessionInfo() 
R version 3.2.3 (2015-12-10) 
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) 
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1 

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] nlme_3.1-125 glmmADMB_0.8.1 MASS_7.3-45 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] Matrix_1.2-3 plyr_1.8.3  magrittr_1.5 tools_3.2.3  
[5] coda_0.18-1  Rcpp_0.12.3  stringi_1.0-1 grid_3.2.3  
[9] stringr_1.0.0 R2admb_0.7.13 lattice_0.20-33 

Answer 1

我找到了解決我的問題的方法。我使用這裏提供的安裝代碼： http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/。我不確定是否有必要，但在運行以下代碼之前，我導航到我的~R/R-3.2.3/library文件夾並刪除了glmmADMB文件夾。

然後我運行下面的代碼。

install.packages("R2admb") 
install.packages("glmmADMB", 
    repos=c("http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/repos", 
      getOption("repos")), 
    type="source") 

這更新了我的glmmADMB到版本0.8.3.3，它糾正了錯誤（通過將它變成警告）。