刪除特定字符串的文本文件中的列

我想刪除特定字符串「Gtype」中的列。從一個.txt製表符分隔文件。我已經在R：df <- df[, -grep("GType.", colnames(df))]中試過這個命令來完成這個任務。但是，我的矩陣太大（超過13 GB），R無法處理它。（錯誤：無法分配大小的矢量....）刪除特定字符串的文本文件中的列

我的輸入文件：

Log.NE122 Gtype.NE122 Log.NE144 Gtype.NE144 
-0.33   AA   1.0   AB

我的預期輸出：

Log.NE122 Log.NE144 
    -0.33  1.0

我想知道它的工作原理在bash。如果有人有其他的選擇....

來源

2014-04-17 user3091668

「Gtype」僅出現在第一行嗎？ – Ashkan

是的，我是桌子的主席。 – user3091668

用awk：

awk 'NR==1{for (i=1; i<=NF; i++) if ($i ~ /Gtype/) a[i]; 
    else printf "%s%s", $i, OFS; print ""; next} 
    {for (i=1; i<=NF; i++) if (!(i in a)) printf "%s%s", $i, OFS; print "" }' file 
Log.NE122 Log.NE144 
-0.33  1.0

來源

2014-04-17 10:28:48 anubhava

嗨Anubhava，我有一個幾乎相似的問題。我的字符串就像這個'RT12-ABS-NSA'或像這個'ADM_THO_CVL2000'。然而，當我改變你的腳本部分去尋找那個字符串時，什麼都沒有發生。你有什麼線索爲什麼？ –

@AndyK：如果沒有查看您的樣本數據和預期結果，很難提出任何建議。如果可能的話，我建議創建一個問題，並提供所有相關的細節。 – anubhava

道歉，Anubhava。你的解決方案有效我已經爲我的目的修改了它 'awk -F「;」 'NR == 1 {for（i = 1; i <= NF; i ++）if（$ i〜/ Gtype /）a [i]; else printf「％s％s」，$ i，OFS;打印「」;下一步} {for（i = 1; i <= NF; i ++）if（！（i in a））printf「％s％s」，$ i，OFS; print「」}}' 但它刪除了我的分號並給我空間。 –

您也可以嘗試使用 'data.table' 包和NULL指定列：

dt <- data.table(df) 
dt[, colToDelete := NULL]

「數據.table「試圖在不需要複製的情況下完成大部分操作。您在data.frame上執行的方式需要進行復制。

來源

2014-04-17 13:36:08

'setDT（df）'甚至可以通過引用轉換來防止'data.frame'到'data.table'的拷貝。 'setDT（df）[，col_to_delete：= NULL]' – Arun

刪除特定字符串的文本文件中的列

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