在R中繪製定向多圖形

我從來沒有在R中使用任何圖形繪圖包，我熟悉基本繪圖命令和ggplot2包。我發現的（但還沒有試用過）是Rgraphviz，network和igraph包。所以，我想問問你，這包有簡單的學習曲線，滿足下列要求：在R中繪製定向多圖形

擁有簡單的佈局引擎（春季布局，隨機，...）
試圖得出兩者之間的多條邊頂點，以便它們不會重疊。作爲獎勵，它能很好地調整這一點。
可以畫循環。
頂點和邊緣標籤，頂點和邊的大小和顏色都可以調整。
（無需任何像鏈接分析，最短路徑，最大流量等，但不錯的圖形算法，如果存在的話）

來源

2011-04-04 Timo

的igraph包似乎滿足您的要求，與tkplot()功能幫助調整如果需要最終的佈局。

下面是使用的例子：

s <- cbind(A=sample(letters[1:4], 100, replace=TRUE), 
      B=sample(letters[1:2], 100, replace=TRUE)) 
s.tab <- table(s[,1], s[,2]) 
library(igraph) 
s.g <- graph.incidence(s.tab, weighted=T) 
plot(s.g, layout=layout.circle, 
    vertex.label=c(letters[1:4],letters[2:1]),  
    vertex.color=c(rep("red",4),rep("blue",2)), 
    edge.width=c(s.tab)/3, vertex.size=20, 
    vertex.label.cex=3, vertex.label.color="white")

enter image description here

使用交互式顯示屏（有使用rgl 3D顯示的可能性），它看起來像（我稍微移動一個頂點之後）：

tkplot(s.g, layout=layout.circle, vertex.color=c(rep("red",4),rep("blue",2)))

enter image description here

最後，您甚至可以將圖表導出爲最常見的格式，例如graphviz的dot。

來源

2011-05-01 17:50:11 chl

感謝。當我需要再次繪製圖表時，我會嘗試igraph！僅僅爲了一些信息，在我問了這個問題後，我和RGraphviz一起去了，並且通過重新編寫我的原始任務，擺脫了繪製多邊的需求。 – Timo 2011-05-02 13:06:12

@Timo很高興聽到您用graphviz找到自己的方式。我也使用它很多。這只是'igraph'是最強大的，IMO。（順便說一句，我的+1給你的Q，當我回答時，我沒有投票）---) – chl 2011-05-02 13:24:49

multigraph R軟件包也很有用。對於上述示例bmgraph重複這樣圖表：

library("multigraph") 
bmgraph(s.tab, layout = "circ", pch = 16:16, pos = 0, vcol = 6:7, lwd = 3, cex = 9)

而對於定向版本：

bmgraph(s.tab, "circ", pch = 16:16, pos = 0, vcol = 6:7, lwd = 3, cex = 9, directed = TRUE)

來源

2016-09-16 12:44:35 JARO

在R中繪製定向多圖形

回答

相關問題