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我正在使用NetworkX生成一些噪音數據的圖形。我想通過刪除虛假的分支來「清理」圖表,並希望避免重新發明輪子。修剪NetworkX圖形的功能?
例如,鏈接的圖片顯示了一組樣圖,作爲通過灰線連接的彩色節點。我想修剪由白色框指示的節點/邊緣:http://www.broadinstitute.org/~mbray/example_tree.png
實質上,要移除的節點/邊緣通常只有少數節點(長度爲< 3)。通過刪除它們,我希望有一棵樹具有最小的分支,但保留的分支是「適當」的長。
在我開始創建代碼以檢查要刪除的子樹之前,有沒有可用於此目的的NetworkX函數?
我喜歡這個,至少作爲開始。分支通常是非常不對稱的,所以找到一個修剪閾值不應該太難。謝謝! – braymp