將特定位置的字符串替換爲文本，然後重寫所有文本

我正在處理一個文本，其中有幾列和多行，如下所示：將特定位置的字符串替換爲文本，然後重寫所有文本

我想將索引[4]中的「A」替換爲「B」。

ATOM 1 N ARG A 88 63.055 9.295 9.736 1.00 25.54   N 
ATOM 2 CA ARG A 88 61.952 10.108 10.353 1.00 26.02   C

和重寫我的文字：

ATOM 1 N ARG B 88 63.055 9.295 9.736 1.00 25.54   N 
ATOM 2 CA ARG B 88 61.952 10.108 10.353 1.00 26.02   C

我使用這個劇本，但它改變了所有的「A」至「B」。

file = open('1qib.pdb', 'r') 
file2 = open('new.pdb', 'w') 

for i, line in enumerate(file): 
    s = line.split()[4] 
    file2.write(line.replace(s, "B")) 

file.close() 
file2.close()

來源

2016-02-24 Berk

嘗試做這樣的：

file = open('1qib.pdb', 'r') 
file2 = open('new.pdb', 'w') 

for i, line in enumerate(file): 
    spl = line.split() #1 
    spl[4] = spl[4].replace("A", "B") #2 
    newline = " ".join(spl) #3 
    file2.write(newline) #4 

file.close() 
file2.close()

步驟一步的解釋：

請注意，您在這裏執行的操作是將該行首先拆分爲字符串列表。
```
spl = line.split() 
```
然後你只想要替換字符串新的項目列表的指數= 4。
```
spl[4] = spl[4].replace("A", "B") 
```
最後你重新加入列表
```
newline = " ".join(spl) 
```
你把它寫入文件再次
```
file2.write(newline) 
```

來源

2016-02-24 08:05:11 Ian

我如何申請格式之前波紋管構造新文本？「％-6s％5d％4s％1s％3s％1s％4d％1s％8.3f％8.3f％8.3f％6.2f％6.2f％2s％2s」 – Berk

format * below *？ – Ian

正如我試圖保持PDB文件的標準格式。 – Berk

line.replace(src, dst)的意思是「把字符串line與dst取代的src所有實例」。因此，即使您將src定義爲「line中的第五個詞」，替換操作將應用於整條線。

所以，不要做 - 取代像這樣只有該實例：

with open('1qib.pdb', 'r') as fin, open('new.pdb', 'w') as fout: 
    for line in fin: 
     items = line.split() 
     items[4] = "B" 
     fout.write(" ".join(items))

來源

2016-02-24 08:03:19

將特定位置的字符串替換爲文本，然後重寫所有文本

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