在R中是否有等價的unix「comm」命令？

Question

我有一個主文件，其中包含唯一ID列表，並且希望將三個文件與此ID的子集對齊，最後是： 第1列（id1，id2，id3，id4等）第2列（空格，id2，空間，空間）第3列（id1，id2，空間空間）第4列（id1，空間id3空間）等 我在R中有一個唯一的列表，在UNIX中的「comm」命令似乎這樣做 - 是否有一個等效在R？

Answer 1

您的數據的結構不是很清楚，但是如果你開始用下面的載體：

R> master <- paste("id",1:10,sep="") 
R> sub1 <- paste("id",c(2,3,5),sep="") 
R> sub2 <- paste("id",c(1,4,8,9),sep="") 
R> master 
[1] "id1" "id2" "id3" "id4" "id5" "id6" "id7" "id8" "id9" "id10" 
R> sub1 
[1] "id2" "id3" "id5" 
R> sub2 
[1] "id1" "id4" "id8" "id9" 

您可以從您的主 ID列表數據幀，並使用這些ID作爲行名稱：

R> df <- data.frame(master=master, row.names=master) 
R> df 
    master 
id1  id1 
id2  id2 
id3  id3 
id4  id4 
id5  id5 
id6  id6 
id7  id7 
id8  id8 
id9  id9 
id10 id10 

然後，你可以爲每個子集添加新列方式如下：

R> df[sub1, "sub1"] <- sub1 
R> df[sub2, "sub2"] <- sub2 

結果如下：

R> df 
    master sub1 sub2 
id1  id1 <NA> id1 
id2  id2 id2 <NA> 
id3  id3 id3 <NA> 
id4  id4 <NA> id4 
id5  id5 id5 <NA> 
id6  id6 <NA> <NA> 
id7  id7 <NA> <NA> 
id8  id8 <NA> id8 
id9  id9 <NA> id9 
id10 id10 <NA> <NA>