你怎麼grep一個文件，並獲得下一個選項卡的兩行？

我可以從文本文件中使用以下shell命令來grep包含模式「基因」和下兩個連續行的行。你怎麼grep一個文件，並獲得下一個選項卡的兩行？

grep -A 2 ' gene' file

輸出：

 gene   1..1515 
        /locus_tag="MSMEI_RS00005" 
        /old_locus_tag="MSMEI_0001" 
    gene   2109..3302 
        /locus_tag="MSMEI_RS00010" 
        /old_locus_tag="MSMEI_0003"

現在我的目標是用標籤打印連續線，如

gene   1..1515   /locus_tag="MSMEI_RS00005" /old_locus_tag="MSMEI_0003" 
gene   2109..3302  /locus_tag="MSMEI_RS00010" /old_locus_tag="MSMEI_0003"

我怎麼做這與外殼相同的grep命令？

來源

2017-04-20 user1427429

什麼是您的操作系統？ –

使用Ubuntu – user1427429

如果內容中有4列沒有列內容空間，如示例中所示，請嘗試將輸出管道輸出到'xargs -n4 |列-t「 – Sundeep

隨着SED：

sed -nEe '/^  gene/{N;N;s/\n */\t/g;p}' file

/ gene/在匹配該模式的行上工作，然後我們讀取兩個N分機行，s ubstitute換行符和空格，然後選擇製表符，然後p rint。

來源

2017-04-20 11:01:11 ilkkachu

你不需要grep它，Awk可以利用其getline()函數來獲得未來兩個後續行做操作，

awk 'BEGIN{OFS="\t"}/gene/{getline n1; getline n2; print $0, n1,n2}' file

（或）如果你是不屑與前導空格，帶他們使用gsub()功能，

awk 'BEGIN{OFS="\t"}/gene/{gsub(/^[[:space:]]+/,"",$0); getline n1; getline n2; print $0, n1,n2}' file

來源

2017-04-20 10:56:21 Inian

你怎麼grep一個文件，並獲得下一個選項卡的兩行？

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