ggplot2 - 打印劇情氣球內存

是否期望將大型ggplot打印到PDF會導致RSession內存膨脹？我有一個大約72兆字節的ggplot2對象。打印到PDF時，我的RSession增長到2 gig。這是預期的嗎？有沒有方法來優化性能？我發現由此產生的PDF是巨大的〜25meg，我不得不使用一個外部程序縮小（50kb沒有視覺損失！）。有沒有辦法打印到PDF質量較低的圖形？或者也許一些參數打印或ggplot，我沒有考慮？ggplot2 - 打印劇情氣球內存

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2011-07-27 SFun28

對於大型數據集，我發現在整理ggplot（即使ggplot提供相同計算）之前預處理數據很有幫助。

ggplot必須非常一般：它不能預測什麼統計或GEOM要添加以後，所以它是非常困難的有優化的事情（分拆式應用，結合策略可能會導致爆炸intermediat內存要求）。 OTOH，你知道你想要什麼，並可以相應地進行預先計算。

大的pdf表示您要麼有很多重疊繪圖，要麼會產生太小而無法看到的對象。在這兩種情況下，通過應用適當的彙總統計數據（例如，hexbin或boxplot而不是scatterplot）可以獲得很多收穫。

我想我們不能告訴你更多沒有你在做什麼的細節。因此，請創建一個最簡單的示例並/或上傳正在製作的壓縮圖。

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2011-07-27 19:50:41 cbeleites

你是對的，在這種情況下，我有兩個overplotting和對象太小，看不到。謝謝！ – SFun28

爲了解決問題的第二部分，R並未嘗試優化PDF。如果你重疊了很多點，這會導致一些荒謬的行爲。您可以使用qpdf來後處理PDF。

從傳聞的第一個問題來看，似乎中型數據集上的圖表佔用了大量內存，但這僅僅是我的經驗。其他人對於這是否是如此，可能會有更多的意見。

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2011-07-27 19:33:26

以像png這樣的位圖格式保存可以大大減少文件大小。請注意，這僅適用於最終圖像的某些用途，特別是，它不能放大到PDF格式。但是如果知道最終的圖像大小，它可能是一種有用的方法。

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2011-07-27 20:12:00 Aaron

據我所知，它並沒有減少渲染時間，但？而PDF後處理應該讓你下降到相似的文件大小，而不會失去矢量化。 –

不錯，不會減少渲染時間。我還沒有嘗試PDF後處理，但它聽起來很有用;使用png已經足夠滿足我的需求。 – Aaron

如果這一切都需要，直接進入PNG（或其他位圖格式）是一個更小的步驟。 – Aaron

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