當我通過impute.knn運行它時，Matrix會變成別的東西。

我是R新手，但我有一個微陣列數據集。我在一個位置有一個NA值，我嘗試從庫（impute）使用impute.knn（），但是在通過impute.knn（）函數運行矩陣後，它似乎變成另一個結構。任何人都可以解釋發生了什麼？當我通過impute.knn運行它時，Matrix會變成別的東西。

> m <- as.matrix(m) 

# checking structure 
> str(m) 
    num [1:22283, 1:20] 1942.1 40.1 72.1 4693.6 35.9 ... 
    - attr(*, "dimnames")=List of 2 
    ..$ : chr [1:22283] "1007_s_at" "1053_at" "117_at" "121_at" ... 
    ..$ : chr [1:20] "GSM146778-Normal" "GSM146780-Normal" "GSM146782-Normal" 

# checking missing value of cell 
> m[x,y] 
[1] NA 

# impute missing value 
> m.i <- impute.knn(m, 6) 

# check value of imputed value 
> m.i[x,y] 
Error in r.imp["206054_at", "GSM146784-Normal"] : incorrect number of dimensions 

# check structure of imputed matrix 
> str(m.i) 
List of 3 
$ data  : num [1:22283, 1:20] 1942.1 40.1 72.1 4693.6 35.9 ... 
..- attr(*, "dimnames")=List of 2 
.. ..$ : chr [1:22283] "1007_s_at" "1053_at" "117_at" "121_at" ... 
.. ..$ : chr [1:20] "GSM146778-Normal" "GSM146780-Normal" "GSM146782-Normal" "GSM146784-Normal" ... 
$ rng.seed : num 3.62e+08 
$ rng.state: int [1:626] 403 50 1992223309 -108730617 1600482030 698744776

來源

2012-10-08 Steve Hwang

什麼是'x'，什麼是'y'？請發佈一個可重複的例子！ - 包含數據的一部分 – mnel

@mnel，x和y是行/列名稱。詹姆斯解釋說，你可以用'$'字符來調用矩陣，所以我得到了我所需要的。謝謝你的幫助！ –

很高興聽到您解決了您的問題，但發佈可重複使用的示例仍然不錯（如您在其他問題中所做的那樣） – mnel

它看起來像impute.knn函數返回一個列表，其中包含關於插補的矩陣和其他數據。嘗試使用：

m.i$data[x,y]

來源

2012-10-08 01:35:43 James

我甚至不知道你可以調用這些變量。這將是非常有價值的。還有一個問題：有沒有辦法保存數據？當我嘗試> m.i < - as.matrix（m.i $ data）時，出現錯誤：$運算符對原子向量無效 –

'm.i $ data'是矩陣。當你覆蓋，你確定你還沒有調用這個，現在'm.i'不再是列表嗎？ – James

啊，是的;我的錯誤。感謝您的澄清 –

當我通過impute.knn運行它時，Matrix會變成別的東西。

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