2010-02-26 138 views
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我有一個情節(示例代碼粘貼在下面),我試圖通過自己的標籤添加系列信息。我不想繪製「p1s1」「p1s2」「p3s4」,我想要「處理1」「處理2」「處理3」。我已經使用關卡(series_id)來獲取唯一的系列名稱,並使用查找表來獲取描述。 (我認爲這讓他們按照他們繪製的順序?),並且我在一個名爲treatment_descriptions的矢量中有這些描述。如何將自定義系列標籤添加到R的ggplot中的圖例?

從文檔我認爲我應該在這裏使用一個規模,但我不知道哪一個,或者如何去做。類似於:scale_something(name =「Treatment Descriptions」,breaks = NULL,labels = treatment_descriptions,formatter = NULL)?但是這應該去哪裏?

library(ggplot2) 

# Create a long data.frame to store data... 
growth_series = data.frame ("read_day" = c(0, 3, 9, 0, 3, 9, 0, 2, 8), 
"series_id" = c("p1s1", "p1s1", "p1s1", "p1s2", "p1s2", "p1s2", "p3s4", "p3s4", "p3s4"), 
"mean_od" = c(0.6, 0.9, 1.3, 0.3, 0.6, 1.0, 0.2, 0.5, 1.2), 
"sd_od" = c(0.1, 0.2, 0.2, 0.1, 0.1, 0.3, 0.04, 0.1, 0.3), 
"n_in_stat" = c(8, 8, 8, 8, 7, 5, 8, 7, 2) 
) 

> # Now gives us some example long form data... 
> > growth_series 
> read_day series_id mean_od sd_od  n_in_stat 
> 1  p1s1  0.6  0.10   8 2  
> 3  p1s1  0.9  0.20   8 3  
> 9  p1s1  1.3  0.20   8 4  
> 0  p1s2  0.3  0.10   8 5  
> 3  p1s2  0.6  0.10   7 6  
> 9  p1s2  1.0  0.30   5 7  
> 0  p3s4  0.2  0.04   8 8  
> 2  p3s4  0.5  0.10   7 9  
> 8  p3s4  1.2  0.30   2 2 

# Plot using ggplot... 
ggplot(data = growth_series, aes(x = read_day, y = mean_od, group = series_id, color = series_id)) + 
geom_line(size = 1.5) + 
geom_point(aes(size = n_in_stat)) + 
geom_errorbar(aes(ymin = mean_od - sd_od, ymax = mean_od + sd_od), size = 1, width = 0.3) + 
xlab("Days") + ylab("Log (O.D. 730 nm)") + 
scale_y_log2() + 
scale_colour_hue('my legend', breaks = levels(growth_series$series_id), labels=c('t1', 't2', 't3')) 

回答

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也許你可以重新標記你的因素?

growth_series$series_id <- factor(
    growth_series$series_id, 
    labels=c('treatment 1', 't2', 't3')) 

或者,如果你還在尋找scale_something,它應該是scale_colour_hue()

... + scale_colour_hue('my legend', 
    breaks = levels(growth_series$series_id), 
    labels=c('t1', 't2', 't3')) 
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謝謝,第一個建議的工作,第二個也沒有,我會保持開放的問題,現在,因爲我認爲應該有更好的方法來做到這一點。我的描述很長,所以讓他們在桌面上看起來非常醜陋,但我想我不需要把它們放到桌子上,直到我進行繪圖之前,所以這不是什麼大問題。乾杯,約翰 – John 2010-02-26 16:49:58

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第二個有什麼問題?順便說一句,「...」代表你的組ggplot()+ geom_line + .. + scale_y_log2 – xiechao 2010-02-26 17:04:16

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當然,我嘗試過,但是我得到一個語法錯誤,它是否適合你? – John 2010-02-26 20:35:28

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