AWK僅打印數組中某個字段的編號。 [R

Question

我印像這樣的列表（信息[1]）：

DP=366 
DP=181 
DP=254 
DP=463 

而且我想擺脫DP =，並只在R.

事後處理數據的數量結束了

這個腳本AWK我得到前面的列表：

substr($1,1,1) != "#"{ 
split ($8, info, ";"); 
num = asort(info); 
for (i=1; i<=num; i++) { 
    if (info[i] ~ "DP") { 
     print info[i] 
     } 
    } 
} 

我想，正則表達式會有所幫助，但不知道在AWK使用。提前致謝！

Answer 1

試試這個：（僅僅是修改原來的代碼）：

substr($1,1,1) != "#"{ 
split ($8, info, ";"); 
num = asort(info); 
for (i=1; i<=num; i++) { 
    if (info[i] ~ "DP") { 
     sub(/DP=/,"",info[i]) 
     print info[i] 
     } 
    } 
} 

Answer 2

使用awk

awk -F= '{print $2}' file 
366 
181 
254 
463 

Answer 3

如果您在輸入更多的欄目，你可以說：

awk '{sub("[^0-9]*", "", $1)}1' inputfile 

Answer 4

在R中可以使用：

sub("^.+\\=", "", info) 

無需循環。只有使用awk的原因是如果文件太大而不適合內存。