2013-03-04 98 views
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我要去不喜歡EMBOSS軟件包或史密斯 - watterman算法大序列的算法。所以我將需要一種方法來創建不同大小的矩陣,所以我的問題是哪個庫爲我提供了最好的性能,並且易於使用。矩陣處理大序列

P.S:我知道,OpenCV中,並加速可以處理矩陣,但我不知道是否有良好的做就可以操作。

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你可以用'的std ::矢量只是做<性病::矢量>'但是,如果你想使用libary隨便挑一個,並用它去了,沒必要把時間浪費在這是最好的。只要確保代碼足夠一般,以便您可以簡單地更換庫並使用其他庫,這樣您就可以在不同的庫之間進行測試 – dchhetri 2013-03-04 20:36:11

回答

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如果「最佳性能」的要求,那麼你必須看看NVIDIA CUDA或Intel MKL。像C++ boost uBLAS這樣的庫不關注性能,而是關注可用性。